شناسایی مولکولی و ژنوتایپینگ سویه های اکینوکوکوس گرانولوزوس جدا شده از شتر و سگ در منطقه اصفهان طی سال های 95-1394

سابقه و هدف: هیداتیدوز یکی از مهم ترین بیماری های انگلی زئونوز در سطح جهان است و عامل آن اکینوکوکوس گرانولوزوس می باشد. باتوجه به اهمیت شناسایی ژنوتایپ های انگل در کنترل بیماری، این مطالعه با هدف سنجش تنوع ژنتیکی ایزوله های شتر و سگ در منطقه اصفهان صورت گرفت. مواد و روش ها: این مطالعه با طراحی مقطعی طی سال های 95-1394 روی 51 کبد و ریه شتر آلوده به کیست هیداتید جمع آوری شده از کشتارگاه های صنعتی زرین شهر و نجف آباد و200 کرم بالغ جمع آوری شده از سگ های ولگرد مناطق مختلف جغرافیایی اصفهان جهت شناسایی ژن های میتوکندریایی co1 و nd1 صورت گرفت. dna پروتواسکولکس و کرم بالغ استخراج شده و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، واکنش pcr و تعیین توالی صورت گرفت. به منظور تعیین میزان مشابهت ژنتیکی بین توالی ها و هم چنین موارد ثبت شده در بانک ژن، آنالیز دوبه دو با نرم افزار clustalw2 صورت گرفت. نتایج: روش های pcrو تعیین توالی ژن های co1 و nd1 در سگ و شتر، وجود ژنوتایپ گوسفندی (g1)، گاوی (g3) و شتری (g6) اکینوکوکوس گرانولوزوس را در منطقه اصفهان نشان داد. ژنوتایپ غالب در هر دو میزبان، سویه شایع گوسفندی ((g1 بود. میزان مشابهت ژنتیکی دو ژن nd1 و co1 بین ایزوله های شتر و موارد ثبت شده در بانک ژن 25/30 تا 100 درصد و برای ایزوله های سگ 47/27 تا 100 درصد تعیین شد.نتیجه گیری: ژن های میتوکندریاییnd1 وco1 مارکرهای مولکولی مناسبی برای تعیین تغییرات ژنتیکی ایزوله های شتر و سگ اکینو کوکوس گرانولوزوس می باشد. سویه غالب این کرم در منطقه اصفهان همانند سایر نقاط کشور، ژنوتیپ g1 (استرین شایع گوسفندی) متعلق به کمپلکس g1g3 اکینوکوکوس گرانولوزوس می باشد.

Molecular and genotyping identification of Echinococcus granulosus from camel and dog isolates in Isfahan, Iran (2015-2016)

Background: Hydatidosis is one of the most important zoonotic parasitic disease worldwide caused by Echinococcus granulosus. Given the importance of parasite genotyping in disease control, this study was aimed to evaluate the genetic variation of the camel and dog isolates in Isfahan.Material and Methods: This crosssectional study was done on infected livers and lungs of camels with hydatid cyst (n=51) during 20152016, collected from Zarinshahr and Najafabad industrial abattoir and 200 adult E. granulosus worms collected from stray dogs in different geographical regions of Isfahan for the molecular identification of mitochondrial genes (CO1, ND1). The DNA of protoscolices and adult worms were extracted, the PCR and sequencing were done using specific primers. Pairwise sequence alignment was used to identify the genetic similarity between the sequences and the registered ones in Gen bank using Clustalw2 software.Results: The PCR and sequencing of CO1 and ND1 genes on dog and camel samples showed different E. granulosus genotypes, including the common sheep strain (G1), bovid strain(G3) and camel strain (G6) in Isfahan region. The most frequent strains were the common sheep strain (G1). The genetic similarity between both ND1 and CO1 isolates taken from camel, dog and the isolates registered in Gene bank were 30.25100% and 27.47100% for camel and dog, respectively.Conclusion: Mitochondrial ND1 and CO1 genes are proper molecular markers for identifying the genetic variation of the camel and dog E. granulosus. The dominant strain of the worm in Isfahan, is the same as the other parts of the country, i.e., the G1 genotype (the most common sheep strain) belonged to the G1 G1 E. granulosus complex.