بررسی همبستگی بین متیلاسیون ناحیه ‌پروموتری ژن cyp1a1 و مصرف دخانیات در افراد مبتلا به سرطان معده

سابقه و هدف: سرطان معده یکی از عوامل اصلی مرگ ومیر ناشی از سرطان در شمال ایران است. یکی از عوامل موثر در این امر، مصرف زیاد سموم کشاورزی در این مناطق است. cyp1a1 یکی از اعضای مهم خانواده آنزیمی سیتوکروم p450 است که در مراحل سم زدایی نقش داشته و تغییر الگوی بیان آن تحت تاثیر مکانیسم های ژنتیکی و اپی ژنتیکی، با بروز سرطان ارتباط معنی دار دارد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی ابتدا dna ژنومی نمونه های توموری و سالم معده با روش فنل کلروفورم استخراج و تبدیل بی سولفیتی با استفاده از کیتepitech dna bisulfite انجام شد. نواحی غنی از cpg پروموتر ژن cyp1a1 با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر و سپس با روش توالی یابی بی سولفیتی سنجر و به صورت دو جهته توالی یابی شد. میزان متیلاسیون جایگاه های cpg محاسبه و همبستگی آن با خصوصیات دموگرافیک افراد بیمار با آزمون اسپیرمن بررسی شد. نتایج: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که همبستگی معنادار مثبت بین متیلاسیون برخی از دی نوکلئوتیدهای cpg، به خصوص انواع موجود در توالی مورد توافق xre (xenobiotic response elements)، با مصرف سیگار و سابقه خانوادگی ابتلا به سرطان معده وجود دارد. اما ارتباط معنی داری درخصوص تاثیر سن افراد بر میزان متیلاسیون مشاهده نشد. نتیجه گیری: مصرف دخانیات و سابقه خانوادگی ابتلا به سرطان معده تاثیر مثبت معنی داری بر میزان متیلاسیون پروموتر ژن cyp1a1 دارد. بدین ترتیب می توان از غربال گری میزان متیلاسیون این ژن در افراد سیگاری و دارای سابقه خانوادگی ابتلا به بیماری، به عنوان یک مارکر برای تشخیص سرطان معده استفاده نمود.

Study of the correlation between CYP1A1 gene promoter methylation and smoking in gastric cancer patients

Background: Gastric cancer is one of the main causes of cancer related deaths particularly in northern parts of Iran. It has been recently attributed to the increased application of agricultural pesticides in these areas. CYP1A1 is the prototype member of the cytochrome P450 detoxifying enzymes that its gene expression alterations as a result of genetic or epigenetic changes, has been verified to have significant role on gastric cancer incidence.Materials and Methods: In this crosssectional study, genomic DNA of tumoral and normal stomach tissues was extracted by phenol chloroform protocol and was subjected to bisulfite conversion by the EpiTech DNA Bisulfite kit. CpGrich regions of the CYP1A1 gene promoter was amplified using specific primers and subsequently was sequenced in both directions using direct bisulfite Sanger sequencing method. Methylation rate of the individual CpGs was calculated and its correlation with demographic features was estimated by Spearman's test.Results: Results showed a significant positive correlation between promoter methylation of the CYP1A1 gene, particularly those CpGs existing in Xenobiotic response elements (XRE) consensus sequence, and smoking habit as well as familial history of gastric cancer. However, increasing age showed no significant effect on the methylation rate of the CYP1A1 gene promoter.Conclusion: Smoking and familial history of gastric cancer showed positive correlation with CYP1A1 gene promoter methylation. Screening of the CYP1A1 gene promoter methylation in smokers and individuals having positive familial history of disease may be used as a marker for gastric cancer diagnosis.