>
Fa   |   Ar   |   En
   ارزیابی فنوتیپی، تجزیه ارتباطی و حاشیه‌نویسی ژن‌های مرتبط با پژمردگی برگ گندم نان (.triticum aestivum l) در مرحله گیاهچه‌ای در شرایط تنش خشکی  
   
نویسنده عبدی حسین ,علی پور هادی ,برنوسی ایرج ,جعفر زاده جعفر
منبع علوم زراعي ايران - 1401 - دوره : 24 - شماره : 3 - صفحه:251 -265
چکیده    غربالگری سریع ژرم پلاسم گیاهی در مراحل اولیه رشد و شناسایی مبنای ژنتیکی شاخص پژمردگی برگ گندم در مرحله گیاهچه ای برای برنامه های اصلاحی گندم ضروری است. در تحقیق حاضر، تعداد 290 ژنوتیپ گندم نان ایرانی شامل 90 رقم زراعی و 200 توده بومی در سال 1400 در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در شرایط تنش خشکی در مرحله گیاهچه ای از نظر شاخص پژمردگی برگ مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که بین ژنوتیپ های مورد مطالعه به لحاظ میزان پژمردگی برگ تنوع وجود داشت و توده های بومی به طور معنی داری، (حدود 12 درصد) از نمره پژمردگی بیشتری نسبت به ارقام زراعی برخوردار بودند که این موضوع می تواند نتیجه مستقیم یا غیرمستقیم گزینش باشد. از نظر شاخص پژمردگی برگ حدود نه درصد از ارقام زراعی و سه درصد از توده های بومی در گروه متحمل به تنش خشکی قرار گرفتند. تجزیه ارتباطی با دو روش glm و mlm تقریبا نتایج یکسانی داشت. کروموزم های 3b، 2a، 7b، 1a، 3a، 4b، 5b، 6a و 6b به ترتیب بیشترین تعداد ارتباط نشانگر با شاخص پژمردگی برگ را در کل جمعیت داشتند که تنوع فنوتیپی صفت را از 6 الی 20 درصد توجیه می کردند. حاشیه نویسی نشانگرهای معنی دار، تاییدکننده نتایج تجزیه gwas بود و نشان داده شد که تعداد پنج نشانگر روی کروموزوم های 1a، 2a، 3a و 7b با ژن هایی که در تحمل گیاه گندم به تنش خشکی نقش دارند، هم ردیفی داشتند. جزء جدایی ناپذیر غشا بودن، فسفوریلاسیون پروتئین ها، فعالیت آنزیم های متیل ترانسفراز و اﺗﺼﺎل ﻳﻮن روی (zn2+) بخشی از کارکردهای مولکولی و فرآیندهای زیستی ژن های یاد شده بودند. یافته های تحقیق حاضر، بینشی عمیق در رابطه با پژمردگی برگ گندم های نان ایرانی در شرایط تنش خشکی ارائه می دهد که می توان از آن در برنامه های گزینشی آتی گندم نان استفاده کرد.
کلیدواژه تجزیه ارتباطی در سطح ژنوم، شاخص پژمردگی برگ، کروموزوم، گندم نان و نشانگرهای مولکولی
آدرس دانشگاه ارومیه, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه ارومیه, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه ارومیه, دانشکده کشاورزی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور, ایران
پست الکترونیکی jjafarzadeh52@yahoo.com
 
   phenotyping, association analysis and annotation of genes related to leaf wilting of bread wheat (triticum aestivum l.) at the seedling stage under drought stress conditions  
   
Authors abdi hossein ,alipour hadi ,bernousi iraj ,jafarzadeh jafar
Abstract    rapid screening of plant germplasm in the early stages of growth and determining the genetic basis of wheat leaf wilting index at the seedling stage is necessary for wheat breeding programs. in the present research, leaf wilting index for 290 iranian bread wheat genotypes, including; 90 cultivars and 200 landraces were studied under drought stress conditions at the seedling stage in 2021 in research greenhouse of faculty agriculture of urmia university, urmia, iran. the results showed that there was variation between the studied genotypes for leaf wilting index, and the landraces had significantly 12% more wilting scores than cultivars. this can be attributed to direct or indirect selection by breeders. the leaf wilting index of about 9% of cultivars and 3% of landraces were identified in drought stress tolerant group. gwas had nearly the same results as general lineare model and mlm methods. chromosomes 3b, 2a, 7b, 1a, 3a, 4b, 5b, 6a and 6b, respectively, had the highest number of marker-trait associations in the entire population which explained the phenotypic variation of the trait from 6 to 20%. annotation of significant markers confirmed the results of gwas analysis and showed that five markers on chromosomes 1a, 2a, 3a and 7b were aligned with different genes involved in drought stress tolerance. an integral component of membrane, protein phosphorylation, methyltransferase activity and zinc ion binding were part of the molecular functions and biological processes of the identified genes. the findings of this research provide a deep insight into the variation of leaf wilting traits in iranian bread wheat germplasm under drought stress conditions, which can be used as selction criterium in the national bread wheat improvement programs.
Keywords bread wheat chromosome ,genome wide association study ,leaf wilting index ,and molecular markers
 
 

Copyright 2023
Islamic World Science Citation Center
All Rights Reserved