|
|
|
|
ارزیابی روش مناسب استخراج Dna کپک Aspergillus Niger از رب گوجه فرنگی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
کاراژیان رضا ,حبیبی نجفی محمد باقر ,یاورمنش مسعود ,عدالتیان محمدرضا ,پوریان فر حمیدرضا
|
|
منبع
|
علوم و صنايع غذايي ايران - 1395 - دوره : 13 - شماره : 57 - صفحه:133 -143
|
|
|
|
|
چکیده
|
در این تحقیق روش های استخراج dna آسپرژیلوس نایجر از رب گوجه فرنگی بهینه سازی شده و با همدیگر مقایسه شده اند. به این منظور از روش های کلاسیک استخراج بهینه سازی شده و روش های مبتنی بر کیت تجاری استفاده شد. اسپور کپک آسپرژیلوس نایجر در غلظت های مختلف (101، 103، 105 cfu/gr) به رب گوجه فرنگی اضافه شد و پس از رشد و ایجاد میسیلوم کپک استخراج dna با پنج روش انجام شد.تفاوت روش های به کار گرفته شده بر اساس استفاده از نیتروژن مایع، اولتراسوند و محلول های لیز کننده دیواره سلولی بود. این روش ها از نقطه نظر کمیت و کیفیت dna استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفتومتری با دستگاه نانودراپ مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین با استفاده از الکتروفورز ژل dna استخراج شده از لحاظ عدم مشاهده هاله و نبود آلودگی پروتئینی و جهت بررسی وجود ممانعت کننده های pcr در نمونه های dna استخراج شده عملیات pcr با استفاده از پرایمرهای پیشرونده و پس رونده طراحی شده انجام شد. نتایج نانودراپ و الکتروفورز ژل dna و نتایج pcr در 5 روش موید این مطلب است که روش 1 مناسب ترین روش برای استخراج dna این کپک از رب گوجه فرنگی می باشد.
|
|
کلیدواژه
|
استخراج Dna، آسپرژیلوس نایجر، رب گوجه فرنگی
|
|
آدرس
|
دانشگاه فردوسی مشهد, ایران, دانشگاه فردوسی مشهد, دانشکده کشاورزی, گروه علوم و صنایع غذایی, ایران, دانشگاه فردوسی مشهد, دانشکده کشاورزی, گروه علوم و صنایع غذایی, ایران, دانشگاه فردوسی مشهد, دانشکده کشاورزی, گروه علوم و صنایع غذایی, ایران, جهاددانشگاهی مشهد, گروه پژوهشی زیست فناوری قارچ های صنعتی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
pourianfar@acecr.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation suitable method for DNA extraction Aspergillus niger from tomato paste
|
|
|
|
|
Authors
|
Poriyan Far Hamid Reza ,Yavar manesh Masuood ,Habibi Najafi Mohammad Bagher ,Edalatian Mohammad reza ,Karazhiyan Reza
|
|
Abstract
|
In this research different methods of DNA extraction from Aspergillus niger in tomato paste have been optimized and compared with each other. For this purpose classical optimization techniques and commercial Kit base methods were used. Mold spores of Aspergillus niger at different levels (101, 103 and 105 CFU/g) were added to the tomato paste. After mycelium growth DNA extraction was perfomed by five methods. Different methods employed by use the Liquid nitrogen, ultrasonic and lysis solution in the cell wall. These methods in terms of quality and quantity of DNA extracted were studied using spectrophotometer with NanoDrop. The absence of smear, protein contamination and no presecnce of PCR inhibitors determined with PCR that performed forward and reverse primers. Result of gel electrophoresis and PCR assay showed that Method 1 is the most appropriate method for DNA extraction is the mold of tomato paste.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|