مقایسه روش بهینه‌شده استخراج dna از کپک‌های آسپرژیلوس، پنی سیلیوم و رایزوپوس در رب گوجه‌فرنگی

در این تحقیق از روش بهینه سازی شده استخراج dna برای استخراج dna آسپرژیلوس نایجر، پنی سیلیوم کریزوژنوم و رایزوپوس اوریزا از رب گوجه فرنگی استفاده شد. روش مذکور مطابق با روش معرفی شده السامرایی بود که تغییراتی در غلظت محلول های بافر استخراج و بعضی مراحل آن داده شد تا روش بهینه سازی شود. اسپور کپک های مورد نظر در مقادیر مختلف (10^1، 10^3، 10^5 cfu/gr) به رب گوجه فرنگی اضافه شد و پس از رشد و ایجاد میسیلوم کپک استخراج dna انجام شد. dna های استخراج شده از نقطه نظر کمیت و کیفیت dna استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفتومتری با دستگاه نانودراپ مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین با استفاده از الکتروفورز ژل dna استخراج شده از لحاظ عدم مشاهده هاله و نبود آلودگی پروتئینی مورد بررسی قرار گرفتند. جهت بررسی وجود ممانعت کننده های pcr در نمونه های dna استخراج شده عملیات pcr با استفاده از پرایمرهای پیش رونده و پس رونده طراحی شده انجام شد. نتایج نانودراپ و الکتروفورز ژل dna و نتایج pcr موید این مطلب است که این روش برای استخراج dna این کپک ها از رب گوجه فرنگی مناسب میباشد.