|
|
شناسایی مولکولی خرچنگ گرد (brachyuran: oziinae) epixanthus frontalis از سواحل صخره ای استان بوشهر با استفاده از روش بارکدگذاری dna
|
|
|
|
|
نویسنده
|
چناری فریده ,نبوی محمدباقر ,یوسفی سیاهکلرودی سیامک ,سالاری محمدعلی ,سواری احمد ,ذوالقرنین حسین
|
منبع
|
مجله علمي شيلات ايران - 1400 - دوره : 30 - شماره : 4 - صفحه:161 -171
|
چکیده
|
گونهfrontalis epixanthus تنها گونه از جنس epixanthusدر خلیج فارس است که دارای الگوهای رنگی مختلف میباشد. ازآنجاییکه وجود گونههای مخفی در میان سختپوستان دریایی بسیار رایج است، هدف مطالعه حاضر شناسایی دقیق و بررسی احتمال گونههای مخفی در میان نمونههای حاضر است. به همین منظور از 4 الگوی رنگی منسوب به گونه frontalis e. از سواحل صخرهای استان بوشهر نمونهبرداری انجام شد. سپس اولین گونوپودهای جنس نر، جداسازی گردیدند و با میکروسکوپ الکترونی نگاره (sem) مورد عکسبرداری قرار گرفتند. جهت مطالعات مولکولی، dna نمونهها با استفاده از روش تغییر یافته فنل-کلروفروم استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (coi) تکثیر و توالییابی شد. نتایج مطالعه حاضر نشان داد، توالی نوکلئوتیدی این قطعه ژنی میتوکندریایی (coi)، در تمام مورفوتایپهای رنگی بر هم منطبق نیستند و این نتایج در توپولوژی درختان تکاملی برای هر دو آنالیز (maximum likelihood, bayesian) منعکس شد. مطالعه فراساختار قسمت راسی اولین گونوپود جنس نر نیز نشان داد، تفاوتهایی اساسی در قسمت راسی این اندام در برخی مورفوتایپهای رنگی دیده میشود. بررسی حاصل نشان داد، با وجود اینکه نمونههای مورد مطالعه از نظر خصوصیات ریختشناسی به عنوان یک گونه شناسایی شدهاند، ممکن است متعلق به گونههای جداگانه باشند که این فرآیند مستلزم بررسیهای بیشتر با سایر نشانگرهای مولکولی میباشد.
|
کلیدواژه
|
سیتوکروم اکسیداز میتوکندری، فراساختار، گونوپود، خلیج فارس
|
آدرس
|
دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی خرمشهر, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی خرمشهر, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین-پیشوا, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی خرمشهر, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی خرمشهر, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی خرمشهر, ایران
|
پست الکترونیکی
|
zolgharnein@kmsu.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
molecular identification of epixanthus frontalis (brachyuran: oziinae) from the rocky shores of bushehr province using dna barcode method
|
|
|
Authors
|
chenari farideh ,nabavi seyyed mohammad bagher ,yousefi siahkalroudi siamak ,salari mohammad ali ,savari ahmad ,zolgharnein hossein
|
Abstract
|
epixanthus frontalis is the only known species of the genus epixanthus from the persian gulf which include color polymorphic specimens. considering that cryptic species are common among crustaceans, the aim of this study was to identify the cryptic species complexes the collected samples from the persian gulf. for this purpose, 4 colorful morphotypes of e. frontalis collected from rocky shores along bushehr province. then the first male gonopods was separated and photographed by scanning electron microscopy (sem). for molecular studies samples of dna extracted by using phenol-chloroform and mitochondrial cytochrome oxidase subunit gene segment (coi) was pcr and sequenced. the results showed that the nucleotide sequence of this gene fragment of the mitochondrial (coi) is not identical in all colorful morphotypes. these results reflected in the evolution of tree topology for all two analyses (maximum likelihood, bayesian). the study of apical ultrastructure segments of the first male species showed that it can be seen fundamental differences in the apical organs in some colorful morphotypes. results of this study indicated that although the specimens assigned to single species morphologically, they may belong to different species based on their genotype. further molecular studies with specific markers are needed for molecular identifications.
|
Keywords
|
coi ,ultrastructure ,gonopod ,persian gulf
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|