بررسی کاربرد توالی‌یابی ناحیه کنترلی (d loop) dna میتوکندریایی در مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت‌های تاسماهی ایرانی (acipenser persicus borodin, 1897) دریای خزر

هدف از تحقیق حاضر بررسی تعیین ساختار ژنتیک جمعیت تاسماهی ایرانی (acipenser persicus) دریای خزر با روش توالی یابی قطعه ناحیه کنترلی dna میتوکندریایی بود. برای این منظور، تعداد 45 نمونه باله تاسماهی ایرانی از آب های ساحلی مناطق مختلف دریای خزر جمع آوری گردید. ناحیه کنترلی با استفاده از روش pcr تکثیر و توالی یابی با استفاده از روش استاندارد انجام پذیرفت. تعداد 12هاپلوتیپ متفاوت در بین نمونه های بررسی شده، مشاهده گردید. تنوع هاپلوتایپی و نوکلئوتیدی در نمونه ها به ترتیب برابر با 0.037 ±0.795 و 0.0046 ±0.0062 بدست آمد. بیشترین تعداد هاپلوتایپ (7 عدد) در بین نمونه های رودخانه سفیدرود بود که از این تعداد 3 هاپلوتایپ a، b و e اختصاصی بوده و در سایر مناطق مشاهده نشدند. نتایج تجزیه و تحلیل شاخص تثبیت (fst) بر اساس روش دوپارامتری و آنالیز واریانس مولکولی (amova) نشان داد که نمونه های رودخانه سفیدرود با نمونه های مناطق روسیه و آذربایجان اختلاف معنی داری دارند (0.001 > p) و در نهایت وجود سه جمعیت شناسایی گردید. با توجه به تنوع بالای موجود در ناحیه کنترلی، توالی این ناحیه می تواند به عنوان یک نشانگر مناسب برای شناسایی و تعیین واحدهای حفاظتی و مدیریتی ذخایر جمعیت های احتمالی تاسماهی ایرانی به کار گرفته شود و همچنین می تواند اطلاعات ارزشمندی از کاربرد روش های مولکولی را به منظور ژنتیک حفاظت این گونه ارائه نماید.

Application of mitochondrial DNA sequences of the control region in genetic variability of Persian sturgeon (Acipenser percicus) Populations from the Caspian Sea

Direct mitochondrial DNA (mtDNA) control region sequencing analysis was used to investigate population genetic structure of Persian sturgeon (Acipenser persicus) in the Caspian Sea. A total of 45 specimens were collected from different locations of the Caspian Sea. mtDNA control region was amplified using PCR. Direct sequencing was performed according to a standard method. The results showed that 12 haplotypes were observed among 45 samples in the method. The highest numbers of haplotypes were observed in the Sefidrud River in which 3 haplotypes A, B and E among them were specific for the river and were not observed in the other locations. The average haplotype diversity (h) and nucleotide diversity ( pi;) were 0.795 ±0.037 and 0.0062 ±0.0046, for control region sequencing, respectively. The results of Fst based on kimura 2 parameters method and analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variations occurred among the samples, and between samples of the Sefidrud and Russia and Azerbaijan are statistically significant (P<0.0001). Therefore, three distinct populations including Sefidrud, Russia and Azerbaijan were identified. As mtDNA control region is a highly variable segment, it may be used as a potential marker for identifying populations and for determining their management and conservation units, leading to the useful application of molecular markers in investigating conservation genetics of the Persian sturgeon.