طراحی روش Nested-PCR sequencing برای تعیین تغییرات ژنتیکی ناحیه غیر کد شونده کنترلی پولیوماویروس BK در بیماران گیرنده پیوند کلیه

زمینه و هدف: پولیوماویروس bk‌ یک عفونت فراگیر باشیوع بیش از 80%در دنیا میباشد. یکی از دلائل اهمیت پولیوماویروس bk ، بروز آسیبهای کلیوی و رد پیوند در بیماران گیرنده پیوند کلیه می باشد. ناحیه غیرکدشونده کنترلی ژنوم پولیوماویروس نقش تنظیمی در بیان ژنها و تکثیر این ویروس دارد، این مطالعه با هدف راه اندازی روشی مولکولی حساس و دقیق بمنظور بررسی الگوی ژنتیکی این ناحیه در بیماران انجام گرفت. روش بررسی: در این مطالعه، تعداد 129 نمونه ادرار از بیماران گیرنده پیوند کلیه جمع آوری گردید. سپس باطراحی و راه اندازی روش ترکیبی pcr آشیانه ای و ترادف یابی (nested-pcr sequencing) برای اولین بار تغییرات احتمالی ایجاد شده در ناحیه غیر کد کننده کنترلی ژنوم پولیوماویروس bk در نمونه های فوق بررسی گردید. یافته‌ها: نمونه های مورد مطالعه از (9/58%) 76 بیمار مرد و (1/41%) 53 بیمار زن جمع آوری گردیدند. میانگین سنین افراد 89/0±0/38 بود. به طور کلی (6/56%) 73 نمونه از نظر حضور پولیوماویروس bk مثبت ارزیابی گردیدند. با بررسی توالی ژنومی، تغییرات ایجاد شده در ناحیه غیر کد کننده کنترلی ژنوم پولیوماویروس bk در نمونه های مثبت تعیین گردید. نتیجه‌گیری: بررسی ناحیه غیر کد شونده کنترلی ژنوم پولیوما ویروس bk در نمونه‌های ادرار بیماران گیرنده پیوند کلیه نشان داد که ژنوتیپ های بازآرایی شده شایع ترین ژنوتیپها در این بیماران می باشند. بررسی این توالی نشان داد که این بازآرایی ها دارای الگوی مشخص و متفاوت از سویه استاندارد آرکی‌تایپ می باشند.