شناسایی جایگاه‌های چند شکلی مهم بر روی ژن msh2 در نمونه‌های سرطان کلورکتال با استفاده از آنالیز نقطه ذوب با وضوح بالا

زمینه و هدف: سرطان کلورکتال(crc) دومین سرطان شایع در کشورهای توسعه یافته است. بیشتر از 10 درصد crc به صورت ارثی می باشد و شامل سندرم لینچ hnpcc وfap می باشد. ژن msh2 بر روی کروموزم 2(p21) قرار دارد و از 16 اگزون تشکیل شده است. msh2 پروتئینی است که در فرایند ترمیمی mmr بعد از همانندسازیdna نقش دارد. پروتئین msh2 به msh6 یا msh3 متصل شده و کمپلکس های muts alpha; و muts beta; را تشکیل می دهد که به ترتیب ناجورجفت های deletion/insertion کوچک و بزرگ را شناسایی می کنند. هدف اصلی این تحقیق بررسی کارایی و توانایی hrma در تشخیص جهش های حذفی سه نوکلئوتیدی و تعیین فراوانی این جهش ها در حالت هموزیگوس وهتروزیگوس در نمونه های سرطان روده بزرگ نسبت به گروه کنترل می باشد.روش بررسی: در پژوهش مورد شاهدی که در سال 1396 1395 انجام شد، به منظور ردیابی جهش حذفی سه نوکلئوتیدیgtg در موقعیت اگزون 12 ژن msh2 از تکنیک hrma استفاده شد. بدین منظور50 نمونه سرطان کلورکتال به همراه 50 نمونه سالم مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا dna ژنومی از نمونه های بافت پارافینه سرطانی استخراج شد و سپس با تکنیک hrma و تعیین توالی یابی مستقیم جهش حذفی سه نوکلئوتیدی gtg مورد بررسی قرار گرفت. کنترل های به کار گرفته شده شامل توالی 96 جفت بازی در حالت تیپ وحشی و 93 جفت بازی در حالت موتانت بود. نسبت مساوی از این دو برای حالت هتروزیگوس این جایگاه به کار گرفته شد. در نهایت تعداد نمونه های به دست آمده در هر گروه در آزمون تجزیه واریانس یک طرفه و مقایسه میانگین lsd مورد مقایسه آماری قرار گرفتند. یافته ها: تعداد نمونه های هتروزیگوس برای این جایگاه در نمونه های سرطان روده بزرگ به طور معنی داری نسبت به دو گروه هموزیگوس حاوی توالی و هموزیگوس حذف کامل بیشتر بود. در مجموع نتایج این پژوهش نشان داد که تکنیک hrma قابلیت تفکیک حذف و الحاق جفت بازها به صورت هموزیگوس و هتروزیگوت را با توجه به اختلاف دمای ذوب(tm) آنها را داردنتیجه گیری: در مطالعه حاضر با توجه به نتایج به دست آمده فراوانی حذف سه نوکلئوتیدی gtg در نمونه های سرطانی نسبت به افراد سالم به صورت معنی داری بیشتر بود. سرطان کلورکتال، hnpcc، تکنیکhrma، ژن msh2