بررسی وجود ژن cry در باسیلوس ترینجینسیس ‌های جدا شده از خاک

زمینه و هدف: باسیلوس ترینجینسیس باکتری گرم مثبت و اسپورزا است. اصلی ترین زیستگاه این باکتری خاک بوده و توانایی تولید انواع متنوعی از پروتئین های کریستالی با خاصیت حشره کشی را داراست. هدف از این مطالعه جداسازی سویه های باسیلوس ترینجینسیس حمل کننده ژن cryاز خاک های نقاط مختلف استان تهران با استفاده از روش multiplexpcr بود. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی تحلیلی مقدار 200 گرم خاک از عمق 10 سانتی متری به طور تصادفی و در مجموع تعداد 100 نمونه خاک از مناطق مختلف شهر تهران جمع آوری شد. سپس بر اساس پروتوکل تایید شده به وسیلهwho، کلنی های مشکوک به باسیلوس تورنجینسیس جداسازی و ایزوله ها از نظر تست های میکروبیولوژیکی و بیوشیمیایی تایید شدند. پس از استخراج dna از تمامی سویه ها، با استفاده از 16s rdna pcr sequencing باسیلوس ترینجینسیس بودن سویه های حاوی ژن cry تایید شد، داده ها با استفاده از آزمون آماری واریانس یک طرفه تجزیه و تحلیل شدند. یافته ها: در نمونه های خاک مورد بررسی، 41 سویه باسیلوس تورینجنسیس شناسایی شد. نتایج mpcr نشان داد که از 14 سویه حامل توکسین کریستالی، 7 سویه (50 درصد) به تنهایی واجد ژن cry1، 4 سویه (5/28درصد) به تنهایی واجد ژن cry2 و 3 سویه (5/21 درصد) به تنهایی واجد ژن cry3 بودند و باندهای مربوطه را نشان دادند. ژنcry4 و cry5 در هیچ کدام از ایزوله ها (صفردرصد) مشاهده کن. نتیجه گیری: با توجه به تنوع بسیار زیاد ژن پروتئین کریستالی و عدم وجود روش های فنوتیپی دقیق در شناسایی حضور پروتئین کریستالی، بنابراین تشخیص هم زمان این ژن ها می تواند با هزینه اندک و سرعت العمل زیاد باسیلوس های حاوی ژن کریستالی را شناسایی نماید.