بررسی پروفایل بیانی mirnaهای اگزوزومی در سلول‌های سرطانی سرویکس (hela) در مقایسه با سلول‌های سالم و بررسی ژن‌های کلیدی وابسته به آنها

مقدمه: سرطان سرویکس، چهارمین سرطان شایع در میان زنان در سرتاسر جهان و یک بیماری هتروژن می باشد. mirnaهای اگزوزومی می توانند به‌عنوان بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف درمانی در سرطان سرویکس در نظر گرفته شوند. مطالعه حاضر با هدف استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای شناسایی mirna ها، ژن ها و مسیرهای مربوط به آنها در اگزوزوم های مشتق شده از سلول سرطانی سرویکس انجام شد.روش‌کار: در این مطالعه، بیان mirnaها و mrnaهای اگزوزومی در سلول های هلا و سالم با آنالیز داده‌های به‌دست آمده از پایگاه geo برای mir-seq و rna-seq در نرم‌افزار  r(نسخه 4.2.1) بررسی شد. پس از آن ژن‌های مشترک میان هدف های mirna و mrna با بیان کاهشی یا افزایشی، از اگززوم ها انتخاب شدند و سپس آنالیزهای go و مسیرهای kegg انجام شد. در پایان، ژن های مشترک برای ایجاد شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین و انتخاب ژن های کلیدی مورد استفاده قرار گرفتند.یافته ها: در مطالعه حاضر، 31 mirna با افزایش بیان و 16 mirna با کاهش بیان در اگزوزوم ها مشاهده شد. همچنین 341 ژن مشترک از هدف های mirna و rna-seq برای آنالیزهای بعدی انتخاب شدند. آنالیز go نشان داد که ژن های مشترک به‌طور معناداری در انتقال لوسین، فعالیت فسفاتازی map کیناز و انتقال گلوتامین نقش دارند. آنالیز kegg نیز پیش بینی کرد که ژن ها در پیری سلولی، مسیر پیام رسانی p53 و سیکل سلولی به‌صورت معناداری نقش دارند. 10 ژن کلیدی شامل ccnb1، bub1، kif20a،mki67، foxm1، birc5، ncaph، zwint، gins2 و asf1b از شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین شناسایی شدند.نتیجه گیری: نتایج شامل شناسایی mirnaهای با تغییر بیان و مشخص کردن ژن های کلیدی در اگزوزوم های مشتق شده از سلول های سرطانی سرویکس بود. این مطالعه می تواند دیدگاه جدیدی را برای تعیین مکانیسم های بالقوه همراه با اگزوزوم های مشتق شده از سلول های سرطانی در پیشرفت سرطان سرویکس ارائه کند.

the expression profile of exosomal mirnas in cervical cancer cells (hela) compared to normal cells and evaluating the key genes related to them

introduction: cervical cancer is the fourth most common cancer among women worldwide and is a heterogeneous disease. the exosomal mirnas could be applied as diagnostic biomarkers and therapeutic targets in cervical cancer. the present study was performed with aim to use a bioinformatics analysis to identify key mirnas and related genes and pathways in exosomes derived from cervical cancer cells.methods: in this study, the differential expression of exosomal mirna and rnas in healthy and hela cells was investigated by analyzing the geo database for mir-seq and rna-seq in r software. subsequently, overlapped mirna target genes and differentially mrna from exosome were selected and then, go and kegg pathway analysis was performed. the overlapped genes were integrated to construct a ppi network and hub genes selection.results: in the present study, it was observed that 31 mirnas were upregulated and 16 mirnas were downregulated in exosomes. also, 341 overlapped genes from mirnas targets and mrna-seq were selected for future analysis. go analysis indicated that overlapped genes were significantly enriched in the leucine transport, map kinase phosphatase activity, and glutamine transport. kegg analysis suggested that the genes were enriched in cellular senescence, p53 signaling pathway and cell cycle. the top ten genes including ccnb1, bub1, kif20a, mki67, foxm1, birc5, ncaph, zwint, gins2, and asf1b were identified from the ppi network.conclusion: the results identified key mirnas with altered expression and characterizing key genes in exosomes derived cervical cancer cells. this study will provide novel insights to determine the potential mechanisms associated exosomes derived from cancer cells in cervical cancer progression.