|
|
انتخاب ژن رفرانس مناسب جهت نرمالیزه کردن داده های کمّی سنجش میکرو rnaها در نمونه پلاسمای افراد مبتلا به سرطان معده
|
|
|
|
|
نویسنده
|
پروایی پگاه ,موندنی زاده مهدیه ,خوانساری نژاد بهزاد ,امامی رضوی نادر امیر
|
منبع
|
مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك - 1395 - دوره : 19 - شماره : 5 - صفحه:12 -20
|
چکیده
|
زمینه و هدف: میکرو rnaهای موجود در گردش خون بیومارکرهایی امیدبخش برای تشخیص و ارزیابی بیماران مبتلا به سرطان میباشد. آزمون واکنش زنجیره ای پلی مراز کمی زمان واقعی(rt-qpcr) روشی حساس برای برآورد میزان بیان میکرو rna ها است. با این وجود، در حال حاضر هیچ توافقی برای انتخاب ژنهای رفرنس مناسب برای آنالیزهای qpcr بر روی میکرو rna در گردش خون وجود ندارد. از این رو، هدف از این مطالعه انتخاب ژن رفرنس مناسب جهت نرمالیزه کردن نتایج rt-qpcr در نمونههای پلاسمای بیماران مبتلا به سرطان معده بوده است.مواد و روشها: بر اساس مطالعات پیشین سه مولکول snord47، u6 و mir-103 به عنوان ژن رفرنس منتخب مورد بررسی قرار گرفتند. بدین ترتیب بعد از استخراج از نمونههای پلاسمای 40 بیمار مبتلا به سرطان معده و 40 نفر سالم، سطوح بیان این مولکولها به روش real-time pcr ارزیابی شد. یافتهها: نتایج نشان داد که تستهای طراحی شده قادر به تشخیص حساس اهداف تعیین شده در یک دامنه خطی مناسب میباشند. بر اساس مقایسه دو گروه افراد بیمار و سالم، اگرچه میزان بیان مولکول mir-103 بین دو گروه یکسان نبود (017/0p=)، rnaهای snord47 و u6 دارای تغیرات سطوح بیانی مشابه بودند. با این وجود تغییرات در بیان مولکول snord47 کمتر از مولکول u6 بود.نتیجهگیری: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که مولکول snord47 دارای سطوح بیانی پایداری در نمونه پلاسمای افراد مبتلا به سرطان معده و افراد سالم است و میتواند به عنوان یک ژن رفرانس مناسب جهت نرمالیزه کردن دادههای کمّی تست qpcr مورد استفاده قرار گیرد.
|
کلیدواژه
|
سرطان معده ,میکرو rna ,rt-qpcr ,ژن رفرنس ,gastric cancer ,mirnas ,reference gene
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی اراک, کارشناسی ارشد زیست فنآوری، گروه زیست فنآوری و پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران , ایران, دانشگاه علوم پزشکی اراک, استادیار، گروه زیست فنآوری و پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران , ایران, دانشگاه علوم پزشکی اراک, استادیار، گروه میکروب شناسی و ایمنی شناسی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران, ایران, دانشگاه علوم پزشکی تهران, محقق، انستیتو سرطان، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران , ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|