تشخیص سریع RNA ویروس HIV-1 به وسیله روش Real-time Transcription mediated amplification

چکیدهزمینه و هدف: روش‌های ملکولی متعددی توسعه یافته‌اند که قادرند با حساسیت و ویژگی متفاوتی hiv-1 را در نمونه‌های بالینی تشخیص دهند. در این مقاله نتایج حاصل از یک مطالعه ارتباط سنجی در راه اندازی و به کارگیری یک روش real-time pcr tma نوین جهت تشخیص هم‌ دمای ویروس hiv-1 ارایه شده است. مواد و روش‌ها: در این مطالعه مقطعی، ست پرایمر و پروب molecular beacon توسط نرم افزارهای اختصاصی و برای یک ناحیه 176 جفت بازی از ژن pol ویروس hiv-1 طراحی شد. برای تعیین حساسیت آنالیتیک واکنش از رقت‌های لگاریتمی 10-107 کپی rnaهای حاصل از رونویسی در آزمایشگاه، به عنوان استاندارد استفاده شد. برای ارزیابی حساسیت و ویژگی کلینیکی واکنش از نمونه‌های با‌لینی‌ استفاده شد که پیش از این مثبت و منفی‌ بودن آنها به وسیله یک تست تجاری معتبر تایید شده بود.یافته‌ها: حساسیت آنالیتیک و کلینیکی این روش به ترتیب معدل 500 کپی در میلی‌لیتر و 3/93 درصد در نظر گرفته شد. پرایمرها و پروب طراحی شده تنها به توالی‌های اختصاصی hiv-1 متصل می‌گردند و مطالعات بیوانفورمانیکی هیچ گونه واکنش متقاطعی با ژنوم سایر ویروس‌های انتقال یابنده از طریق خون و ژنوم انسان نشان ندادند. ویژگی کلینیکی روش نیز به طور تجربی و با بررسی 20 نمونه منفی به وسیله روش real-time tma راه اندازی شده، مورد آزمایش قرار گرفت و معادل 100 درصد در نظر گرفته شد.نتیجه‌گیری: روشtma real-time راه‌اندازی شده به علت دارا بودن سرعت، حساسیت و سادگی می‌تواند به عنوان ابزار مفیدی جهت تشخیص سریع و هم‌ دمای ویروس hiv-1 در نمونه‌های خون و پلاسمای بیماران استفاده شود.واژگان کلیدی: ویروس نقص ایمنی اکتسابی 1، مولکولار بیکن، پروب، تکثیر بواسطه نسخه برداری