بررسی بیوانفورماتیک عملکرد 124-miR بر روی فاکتورهای نسخه‌برداری دخیل در فرایند تمایز نورونی

چکیدهزمینه و هدف: اگرچه ملکول 124-mir به عنوان یک القاکننده نوروژنز شناخته شده است، با این حال بررسی‌های انجام شده بر روی اهداف آن بسیار اندک است و مکانیسم‌های عملکرد آن در تمایز به سمت سلول‌های عصبی و نگهداری سلول‌های عصبی در حالت تمایز یافته ناشناخته می‌باشد. روش میکرواری به عنوان روش استاندارد برای مطالعه کلی ژن‌های تحت کنترل mirnaها مطرح است. با این حال هزینه بسیار زیاد این روش استفاده از آن را در اغلب مراکز علمی با محدودیت مواجه است. از سوی دیگر پیشرفت الگوریتم‌های بیوانفورماتیکی و سیستم‌های مدل‌سازی کامپیوتری منجر به توسعه نرم افزارهای بیوانفورماتیکی شده‌اند که توانایی پیش‌بینی اهداف mrna برای mi-rnaها را دارند. از این‌رو هدف این پژوهش تیوری بررسی بیوانفورماتیک اثر 124-mir بر روی فاکتور‌های نسخه‌برداری دخیل در فرآیند تکثیر سلولی و تمایز به سمت سلول‌های ‌نورونی، با استفاده از نرم افزارهای مختلف و اختصاصی می‌باشد.روش‌ها: با استفاده از الگوریتم‌های مختلف موجود در پایگاه‌های تارگت اسکن، دایانا و میرواک، فاکتورهای نسخه‌برداری که هدف بالقوه عملکرد 124-mir بودند، مشخص شدند. سپس از ژن‌های کاندید شده براساس متغیرهایی هم‎چون قدرت اتصال ناحیه هسته 124-mir و تعداد تکرار ناحیه هدف در قسمت ´3-utr فاکتور رونویسی یک جدول امتیاز تهیه شد. در نهایت فاکتور رونویسی دارای بالاترین امتیاز به عنوان کاندید بررسی‌های عملی انتخاب گشت.یافته‌ها: نتایج بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد که ملکول‌های lamc1، itgb1، ptbp1، sox9، sp1 و efnb1 با بیش‎ترین احتمال ممکن است در مسیر نورون‌زایی تحت اثر 124-mir قرار گیرند.نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد که فاکتور نسخه برداری sp1 تحت کنترل 124-mir می‌باشد و نقش مهمی در فرآیند نوروژنز ایفا می‌کند. از این رو این پروتیین می‌تواند به عنوان کاندید جدید مناسبی جهت بررسی‌های تجربی در نظر گرفته شود.واژگان کلیدی: میکرو rna، فاکتورهای نسخه برداری، نورون‌زایی، بیوانفورماتیک، 124-mir