شناسایی جهش در ژن rnf170 در یک فرد مبتلا به پاراپلژی اسپاستیک توارثی با استفاده از روش توالی یابی کل اگزوم

مقدمه: اراپلژی اسپاستیک توارثی یک بیماری نادر با الگوهای متفاوت توارثی است. شیوع این بیماری در نوع اتوزوم غالب و مغلوب حدود 8/1 در هر 100 هزار نفر است. اغلب افراد مبتلا در ایران حاصل ازدواج خویشاوندی می‌باشند. ضعف و اسپاسم عضلانی، تظاهر اصلی این بیماری است. هدف از مطالعه حاضر، بررسی ژنتیکی یک فرد مبتلا به پاراپلژی اسپاستیک توارثی از طریق روش توالی یابی کل اگزوم بود.روش کار: از یک فرد مبتلا به اختلال راه رفتن و اسپاسم اندام تحتانی و حاصل ازدواج خویشاوندی با الگوی توارث اتوزوم مغلوب نمونه خون محیطی تهیه، dna استخراج و توالی‌یابی کل اگزوم انجام شد. پس از آنالیز داده‌های مرتبط با توالی‌یابی کل اگزوم، جهش مسبب بیماری در فرد مبتلا با استفاده از روش توالی‌یابی سنگر مورد بررسی قرار گرفت. همچنین پدر و مادر جهت تفکیک جهش و ناقل بودن بررسی شدند. این مطالعه توسط کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی اراک تایید شده است (کد ir.arakmu.rec.1401.039). اصول اخلاقی مطابق با رهنمودهای کمیته اخلاق ملی و مقررات cope رعایت شده است. این مطالعه با کد اخلاق ir.uok.rec.1401.015 به تصویب کمیته اخلاق دانشگاه کردستان رسیده است.یافته‌ها: در مطالعه حاضر جهش بیماری‌زای هموزیگوت (nm_030954.4): c.304t>c (p.cys102arg) در اگزون شماره 4 ژن rnf170 در فرد مبتلا شناسایی شد. نوع بیماری، پاراپلژی اسپاستیک توارثی تیپ 85 تعیین شد. همچنین پدر و مادر فرد مبتلا واجد جهش به صورت هتروزیگوت و سالم بودند.نتیجه‌گیری: با استفاده از روش توالی یابی کل اگزوم جهش هموزیگوت در ژن rnf170 شناسایی شد. جهش در این ژن مسبب بیماری پاراپلژی اسپاستیک توارثی می‌شود. با توجه به ازدواج خویشاوندی والدین ناقل، از این یافته می‌توان برای اقدامات پیشگیرانه در فرزندان آینده استفاده کرد. 

identification of mutation in rnf170 gene in a person with hereditary spastic paraplegia using whole exome sequencing method

introduction: hereditary spastic paraplegia is a rare disease with different inheritance patterns. the prevalence of this disease is about 1.8 per 100 thousand people. most of the affected patients are the result of consanguineous marriages. weakness and muscle spasm is the main manifestation of this disease. the purpose of this study was to investigate the mutation analysis of a person with hereditary spastic paraplegia by the whole exome sequencing method.methods: peripheral blood samples were obtained from a person suffering from gait disorder and lower limb spasm with autosomal recessive inheritance pattern. dna extraction and whole exome sequencing was performed. after analyzing the data related to the whole exome sequence, the disease-causing mutation in the affected person was confirm using sanger sequencing method. also, parents were investigated to separate mutation and carrier status. this study was approved by arak university of medical sciences (code ir.arakmu.rec.1401.039). ethical principles have been followed in accordance with the guidelines of the national ethics committee and cope regulations.results: in the present study, a homozygous pathogenic mutation (nm_030954.4): c.304t>c (p.cys102arg) in the rnf170 gene was identified in the patient, therefor, hereditary spastic paraplegia type 85 was confirmed in him. also, the parents of the affected person were heterozygous for the mutation.conclusions: homozygous mutation in rnf170 gene was detected using whole exome sequencing method. a mutation in this gene causes hereditary spastic paraplegia. considering the consanguineous marriage of carrier parents, this finding can be used for preventive measures in future children.