ارزیابی و مقایسه میزان بیان ژن‌های pbk و e2f7 در سرطان کلورکتال بین مراحل اولیه و مراحل پیشرفته بیماری

زمینه و هدف pbk یک پروتئین کیناز فعال‌شده با میتوژن (mapkk) بین mek1/2 و mek7 است و می‌تواند p38 ،jnk و erk را در بسیاری از عملکردهای سلولی فسفوریله کند. خانواده عوامل رونویسی e2f نیز به گروهی از کلاس تنظیم‌کننده‌های سلولی متعلق هستند که هم به‌صورت انکوژن و هم به شکل سرکوب‌کننده تومور عمل می‌کنند. هدف از این مطالعه بررسی بیان pbk و e2f7 در مراحل اولیه سرطان روده بزرگ یا کلورکتال در مقایسه با مراحل بالاتر بر اساس مطالعات آزمایشگاهی و اطلاعات پایگاه اطلس ژنوم سرطان است.مواد و روش ها تعداد 32 نمونه بافت بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال با تاییدیه پزشک متخصص پاتوبیولوژیست طبق معاینه و معیار گزارش‌شده از استیج‌های مختلف، جمع‌آوری شد. پس از استخراج rna و سنتز cdna برای بررسی بیان ژن‌های موردنظر، از تکنیک rt-qpcr در گروه‌های مطالعه استفاده شد. همچنین از آنالیز roc curve درجهت تعیین توانایی هرکدام از ژن‌های انتخاب‌شده برای تفکیک دو جمعیت stage i+ii وstage iii+iv  استفاده شد.ملاحظات اخلاقی این پژوهش در کمیته اخلاق دانشگاه آزاد شهرکرد با کد ir.iau.shk.rec.1399.022 به تصویب رسیده است.یافته ها در این پژوهش نشان داده شد pbk و e2f7 در نمونه‌هایstage i+ii در مقایسه با stage iii+iv سرطان کلورکتال افزایش بیان معنا‌دار پیدا می‌کنند. این داده‌ها با اطلاعات آزمایشگاهی و اطلاعات استخراج‌شده از اطلس ژنوم سرطان تایید شد. همچنین بر اساس aucی به‌دست‌آمده از نمودار roc مشخص شد این دو ژن، به‌طور معنا‌داری در دو جمعیت stage i+ii و stage iii+iv و در سرطان کلورکتال تفکیک‌شدنی هستند.نتیجه گیری با‌توجه‌به نتایج حاصل از این مطالعه می‌توان گفت دو ژن pbk و e2f7 مارکرهای خوبی در تشخیص بیماری در مراحل اولیه سرطان کلورکتال هستند.

evaluation and comparison of pbk and e2f7 gene expression between early and advanced stages of colorectal cancer

background and aim pbk is a mitogen-activated protein kinase (mapkk) among mek1/2 and mek7 and can phosphorylate p38, jnk, and erk in many cellular functions. the e2f transcription factor family also belongs to a class of cellular regulators acting as oncogenes and tumor suppressors. this study aims to investigate the expression of pbk and e2f7 in the early stages of colorectal cancer (crc) compared to advanced stages based on the experimental and tcga (the cancer genome atlas) database.methods & materials a total of 32 tissue samples of patients with crc with the approval of a pathobiologist were collected according to the examination and criteria reported from different stages. after rna extraction and cdna synthesis, the rt-qpcr technique was used to evaluate the expression of the desired genes in the study groups. a receiver operating characteristic (roc) curve analysis was also used to determine the ability of each of the selected genes to differentiate the two populations: stage i+ii and stage iii+iv.ethical considerations in all stages of this research, codes of ethics of research and publication were observed.results in this study, it was shown that the expression of pbk and e2f7 significantly increased in stage i+ii samples compared to stage iii+iv. these data were confirmed by laboratory results and information extracted from the tcga database. also, based on the area under curve obtained from the roc curves, these two genes are significantly distinguishable between stage i+ii and iii+iv populations in crc.conclusion according to the results of this study, pbk and e2f7 genes are good markers in the diagnosis of crc.