تغییرات در بیان ژن‌های sgo1 و sgo1-as1 در بافت‌های توموری کلورکتال در مقایسه با بافت‌های سالم

زمینه و هدف: پروتئین کدگذاری‌شده با ژن sgo1 عضو خانواده پروتئین shugoshin است و در هنگام میتوز از سانترومر محافظت می‌کند. lncrnaها، rnaهای غیرکننده‌ای با طول بیش از دویست نوکلئوتیدی هستند که در تنظیم بیان ژن‌ها نقش دارند. هدف از این مطالعه بررسی بیان sgo1 و sgo1as1 در مراحل متفاوت پیشرفت بیماری و مقایسه الگوی بیانی آن‌ها در بافت‌های توموری در مقایسه با بافت‌های سالم در بیماران سرطان کلورکتال است.مواد و روش ها: چهل نمونه بافت بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال با تاییدیه پزشک متخصص پاتوبیولوژیست طبق معاینه و معیار گزارش شده و چهل بافت نرمال از بخش کاملاً سالم روده همان افراد بیمار نمونه‌گیری بافت به عمل آمد. پس از استخراج rna و سنتز cdna برای بررسی بیان ژن‌های موردنظر، از تکنیک real time rtpcr در گروه‌های مطالعه‌شده استفاده شد. همچنین آنالیز roc curve در راستای تعیین توانایی هرکدام از ژن‌های انتخاب‌شده برای تشخیص بیماری استفاده شد.ملاحظات اخلاقی: در همه مراحل این تحقیق کدهای اخلاق تحقیق و نشر رعایت شده است.یافته ها: در این پژوهش نشان داده شد که sgo1 در نمونه‌های توموری سرطان کلورکتال کاهش معنی‌دار (0/001>p) و sgo1 as1 lncrna افزایش معنی‌داری در مقایسه با بافت‌های سالم مجاور پیدا می‌کنند. همچنین در گروه سنی کمتر از 60 سال در مقایسه با گروه سنی بیشتر از 60 سال بیماران، بیان sgo1 افزایش و بیانsgo1as1 کاهش نشان داد. بر اساس auc به‌دست‌آمده از نمودار roc، مشخص شد که ژن sgo1 با 0/8041=auc وsgo1as1 با 0/6364=auc به طور معنی‌داری قابلیت تشخیص جمعیت سالم از بیمار را در سرطان کلورکتال دارند.نتیجه گیری: با توجه به نتایج حاصل از این مطالعه می‌توان گفت که sgo1as1 و sgo1 به طور چشمگیری در بافت توموری به ترتیب کاهش و افزایش می‌یابند ولی تنها ژن sgo1 به‌منزله یک مارکر خوب برای تشخیص سرطان کلورکتال معرفی می‌شود.

Changes in the Expression of SGO1 and SGO1-AS1 Genes in Colorectal Tumor Tissues, Compared to Healthy Tissues

Background and Aim: The protein encoded by the SGO1 gene is a member of the shugoshin family of proteins and protects the centromere during mitosis. lncRNAs are noncoding RNA with 200 nucleotides lengths, i.e., involved in regulating gene expression. The current study aimed to evaluate the expression of SGO1 and SGO1AS1 in different stages of disease progression; we also compared their expression pattern in tumor tissues with healthy tissues in colorectal cancer patients.Methods Materials: In total, 40 tissue samples of patients with colorectal cancer were reported according to the examination and criteria with the approval of a pathologist. Besides, 40 normal tissues were sampled from a completely healthy part of the intestine of the same patients. After RNA extraction and cDNA synthesis, the Realtime RTPCR technique was used to evaluate the expression of the desired genes in the study groups. ROC curve analysis was also used to determine the ability of each selected gene to diagnose the disease. Ethical Considerations: This study was approved by the Ethics Committee of Shahrekord Azad University (Code: IR.IAU.SHKREC.1398.020).Results The obtained data suggested that SGO1 significantly decreased in the colorectal cancer tumor samples (P<0.001) and SGO1AS1 LncRNA significantly increased expression, compared to adjacent healthy tissues. Additionally, in the age group of below 60 years, compared to the age group of over 60 years, SGO1 expression increased and SGO1AS1 expression decreased. Based on the AUC obtained from the ROC diagram, it was found that the SGO1 gene with AUC=0.8041 and SGO1AS1 with AUC=0.6364 could significantly distinguish a healthy population from patients with colorectal cancer.Conclusion: According to the collected results, SGO1 AS1 and SGO1 were significantly reduced and increased in tumor tissue, respectively; however, only the SGO1 gene was introduced as a good marker for diagnosing colorectal cancer.