بررسی همراهی تغییر ژنتیکی rs8506 c>t در توالی lincrna-nr_024015 در جایگاه اتصالی mir-526b انسانی با خطر وقوع سرطان پستان

زمینه و هدف: rna های بلند غیرکدکننده (lncrna) به عنوان یک کلاس مهم از rna ها با نقش‌های بنیادی در تنظیم بیان ژن گزارش شده‌اند و بنابراین در تکوین انواع سرطان‌ها درگیر هستند. مطالعه گسترده ژنومی gwas برای شناسایی لوکوس‌های وابسته به فنوتیپ در توالی‌های غیرکدکننده استفاده می‌شود. باوجوداین عملکردهای بیولوژیک و ارتباطات دقیق میان لوکوس‌های وابسته به فنوتیپ و lncrna ها هنوز به طور کامل شناسایی نشده‌اند. تاکنون هیچ داده‌ای در ارتباط با همراهی میان پلی‌مورفیسم lincrna-nr_024015 (rs8506c>t) در جایگاه اتصالی mir-526b و استعداد ابتلا به سرطان پستان (bc) و فاکتورهای بالینی گزارش نشده است. بنابراین، هدف مطالعه حاضر ارزیابی اثر rs8506 روی ریسک سرطان پستان است.مواد و روش‌ها: در این مطالعه همراهی میان پلی‌مورفیسم rs8506 c>t و استعداد ابتلا به bc در یک مطالعه موردشاهدی (120 نمونه سرطانی و 120 شاهد سالم) بررسی شده است. ژنوتیپ پلی‌مورفیسم با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمرازپلی‌مورفیسم طولی قطعات محدودشونده (pcr-rflp) بررسی شد. در مرحله بعد میان‌کنش بین پلی‌مورفیسم و فاکتورهای بالینی ارزیابی و میزان or برای محاسبه خطر مشخص شد. ملاحظات اخلاقی: نمونه‌های مورد بررسی در مطالعه از سوی کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد با کد 0215-91 تایید شده‌اند.یافته ها: نتایج ما ارتباطی بین پلی‌مورفیسم rs8506 c>t و خطر وقوع bc در مدل غالب را نشان داد (cc در برابر ct+tt؛ 0/027=p؛ 1/84=or؛ 95%ci ، 3/1-201/067). در مدل هم‌غالب، ژنوتیپ ct یک همراهی معناداری را با bc نشان داده است (0/038 =p). علاوه‌براین مشخص شد که افراد با آلل t در rs8506 خطر افزایش‌یافته‌ای برای سرطان پستان دارند (0/031=p؛ 1/69=or؛ 95%ci، 2/1-731/047). هیچ نوع ارتباطی میان rs8506 و فاکتورهای بالینی شامل متاستاز، درجه توموری و her2 مشاهده نشد. نتیجه گیری: به‌طورکلی، حضور پلی‌مورفیسم rs8506 در توالی lincrna-nr_024015 ممکن است به خطر وقوع سرطان پستان نسبت داده شود. آلل t در این واریانت، افزایش خطر برای وقوع سرطان پستان را ارائه می‌کند؛ بنابراین برای آشکارسازی مکانیسم جزئی همراهی مشاهده‌شده، آنالیزهای کاربردی بیشتری نیاز است.

The Association of Genetic Variant rs8506C>T at miR-526b Binding Site in the LincRNA-NR_024015 Exon with Breast Cancer Risk

Background and Aim: The long noncoding RNAs (lncRNAs) is an important type of RNAs that can regulate gene expression and, therefore, are involved in the development of various cancers. The genomewide association study (GWAS) is used to identify phenotyperelated loci within noncoding regions. However, the biological functions and exact relationships between phenotyperelated loci and lncRNAs have not fully been identified. No study was found on the relationship between rs8506C>T polymorphisms in the lincRNANR_024015 exon and breast cancer susceptibility and clinical factors. Therefore, the present study aimed to evaluate the effect of polymorphism rs8506C>T on the breast cancer risk.Methods Materials: In this casecontrol study, participants were 120 patients with breast cancer, 120 healthy controls. The genetic variant was genotyped by using the Polymerase Chain ReactionRestriction Fragment Length Polymorphism (PCR -RFLP) method. Interactions between the polymorphism and clinical factors were further evaluated, and Odds Ratio (OR) was measured for risk assessment.Ethical Considerations: This study has been approved by the Research Ethics Committee at Shahrekord University of Medical Sciences (code:????) .Results: There was a correlation between rs8506 C>T polymorphism and breast cancer risk in the dominant model (CC and CT+TT genotypes; P=0.027; OR=1.84; 95% CI: 1.067‐3.201). In the codominant model, CT genotype had a statistically significant association with breast cancer risk (P=0.038). Subjects with T allele in the rs8506 polymorphism had an increased risk of breast cancer (OR=1.69; 95% CI: 1.0472.736; P=0.031). No relationship between rs8506 polymorphism and clinical factors including metastasis, tumor grade, and Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2) status was observed.Conclusion: Genetic variant rs8506 C>T polymorphism in the lincRNANR_024015 exon may contribute to the breast cancer risk. Allele T in this variant confers an increased risk of breast cancer. Further functional analyses are required to detect the detailed mechanism underlying the observed association.