شناسایی عوامل قارچی بیماری پوسیدگی ریشه و طوقه گوجه‌ فرنگی در استان هرمزگان

پوسیدگی ریشه و طوقه از بیماری های شایع گوجه فرنگی در مناطق عمده تولید این محصول در استان هرمزگان به شمار می رود. مطالعه حاضر با هدف جداسازی، شناسایی و تعیین فراوانی عوامل قارچی مرتبط با پوسیدگی ریشه و طوقه گوجه فرنگی در استان هرمزگان انجام شد. در مجموع، 984 جدایه قارچی از گیاهان گوجه فرنگی با علائم زردی، پژمردگی و پوسیدگی ریشه و طوقه جداسازی شد. شناسایی جدایه ها بر اساس ویژگی های ریخت شناختی و مقایسه توالی های به دست آمده از ناحیه ریبوزومی فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (its-rdna) و بخشی از ژن فاکتور طویل سازی ترجمه-1 آلفا (tef1-α) با توالی‌های معتبر موجود در بانک ژن انجام شد. بر اساس نتایج حاصل از این تحقیق، بیشترین فراوانی (%73) به جدایه های fusarium oxysporum تعلق داشت و گونه های rhizoctonia solani و f. acutatum به ترتیب با فراوانی هشت و یک درصد جداسازی شدند. نتایج بیماری زایی گونه های قارچی روی گیاهچه های گوجه فرنگی هیبرید سانسید 6189 در مرحله چهار برگ حقیقی نشان داد که هر سه گونه روی گیاهچه های گوجه فرنگی بیماری زا بوده و سبب ایجاد پوسیدگی ریشه و طوقه و زردی و بافت مردگی اندام های هوایی می شوند. جدایه های بیمارگر f. oxysporum با استفاده از آغازگرهای اختصاصی sprl به عنوان f. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici تشخیص داده شدند. این مطالعه، نخستین گزارش از f. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici از مزارع گوجه فرنگی استان هرمزگان و نخستین گزارش از f. acutatum به عنوان عامل پوسیدگی ریشه و طوقه گوجه فرنگی در دنیا است.

identification of fungal agents causing tomato root and crown rot in hormozgan province

root and crown rot is a common tomato disease in the major production areas of hormozgan province. the present study was conducted to isolate, identify, and determine the frequency of fungal agents associated with tomato root and crown rot in hormozgan province. in total, 984 fungal isolates were obtained from tomato plants with yellowing, wilting, and root and crown rot symptoms. identification of the isolates was done based on the morphological characteristics and the comparison of the obtained sequences of the ribosomal internal transcribed spacer region (its-rdna) and parts of the translation elongation factor-1 alpha (tef1-α) gene with relevant sequences available in genbank. according to the results, the highest frequency belonged to fusarium oxysporum isolates (73%), and afterward to rhizoctonia solani and f. acutatum species with eight and one percent frequencies, respectively. the results of the pathogenicity tests of the fungal species on tomato seedlings hybrid sunseed 6189 at the stage of four true-leaves revealed that all three species were pathogenic on tomato seedlings and caused root and crown rot, yellowing, and death of the plant aerial tissues. pathogenic isolates of f. oxysporum were identified as f. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici using sprl-specific primers. to the best of our knowledge, this is the first report of f. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici on tomato in hormozgan province, and the first report of f. acutatum as tomato root and crown rot agent in the world.