|
|
شناسایی مولکولی سوسکهای پوستخوار درختان نارون با استفاده از روش خط شناسه گذاری dna barcoding
|
|
|
|
|
نویسنده
|
امینی سودابه ,نوذری جاماسب ,حسینی رضا
|
منبع
|
دانش گياه پزشكي ايران - 1400 - دوره : 52 - شماره : 1 - صفحه:15 -23
|
چکیده
|
سوسکهای پوستخوار به عنوان یکی از مهمترین آفات درختان جنگلی و فضای سبز به درختان ضعیف حمله و باعث نابودی آنها میشوند. درختان نارون نیز به عنوان یکی از مهمترین میزبانهای سوسکهای پوستخوار شناخته شده اند. این گروه از سوسکها با تغذیه از آوند چوبی درختان نارون و همچنین انتقال قارچ بیماریزای عامل بیماری مرگ هلندی نارون، باعث ضعیف شدن و در نهایت نابودی درختان نارون میشوند. به منظورکنترل و پیشگیری از افزایش خسارت و شیوع بیماری مرگ هلندی نارون شناسایی گونههای سوسکهای پوستخوار به عنوان اولین و مهمترین قدم در مدیریت آنها اهمیت دارد. گونههای سوسکهای پوستخوار از نظر ظاهری بسیار به هم شبیه هستند و شناسایی دقیق آنها خصوصا در مراحل نابالغ با استفاده از صفات مرفولوژیک دشوار و نیازمند استفاده از روشهای جدید مولکولی است. در این مطالعه با استفاده از روش مولکولی خط شناسهگذاری دی ان ای بارکدینگ توالی با طول 580 جفت باز از ژن سیتوکروم اکسیداز زیرواحد یک (coi) با استفاده از جفت پرایمرs1718 و a2411 برای شش گونه از سوسک های پوستخوار جمعآوری شده از روی درختان نارون توالی یابی شدند. توالیهای بدست آمده توسط نرمافزار mega ver.0.7 تجزیه و تحلیل شدند. نتایج نشان داد میانگین تفاوت نوکلئوتیدی بین گونه 1.9 درصد و بسیار بیشتر از تفاوت نوکلئوتیدی درون گونهای 0.03 است که مطابق با قانون بارکد میباشد. نتایج این مطالعه نشان میدهد نمونه ها تا سطح گونه تفکیک شده و توالی دی ان بارکد میتواند به عنوان ابزار قابل اعتماد برای شناسایی و تفکیک سوسکهای پوستخوار درختان نارون استفاده شود.
|
کلیدواژه
|
سوسکهای پوستخوار، سیتوکروم اکسیداز یک، دی ان ای بارکدینگ، نارون
|
آدرس
|
دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, گروه گیاه پزشکی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, گروه گیاه پزشکی, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده علوم کشاورزی, گروه گیاه پزشکی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
rhosseini@guilan.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Molecular identification of elm bark beetles through DNA barcoding
|
|
|
Authors
|
Amini Sudabe ,Nozari Jamasb ,Hosseini Reza
|
Abstract
|
Bark beetles as one of the most important pest group attacked to weak trees in forests and urban trees. Ulmus minor considers as an important host plant for bark beetles. This group of beetles feed on Phloem and transmit the pathogen of Dutch elm disease that cause high damage in Ulmus trees. The first and the most important step in preventing damage and bark beetles management is accurate identification of bark beetles. Because of small size and similarity in morphological characters of bark beetles, identification of this group is difficult and time consuming. In this study a DNAbased method barcoding was used to identify six bark beetles species that collected on Ulmus minor through sequencing 580bp of cytochrome oxidase one genome by using A2411 and CNJ1718 universal primers. Obtained sequences were analyzed by MEGA ver.0 software. The results showed that the mean of interspecies nucleotide variation is 1.9% more than intraspecific variation 0.03% which confirmed DNA barcoding rule. The result showed that specimen identified in species level which proved DNA barcoding as a reliable tool to identify Ulmus bark beetles species.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|