آزمون نتاج جدایۀ ایرانی ویروئید اگزوکورتیس مرکبات در دو پایۀ حساس و متحمل

ویروئید اگزوکورتیس مرکبات citrus exocortis viroid (cevd)، عامل یکی از بیماری‌های‏ مهم اقتصادی به نام اگزوکورتیس مرکبات است‏. در این پژوهش، چندشکلی توالی نوکلئوتیدی و ساختار جمعیت cevd در دو میزبان متحمل و حساس (به ترتیب، نارنج (citrus aurantium l.) و سیترنج ((poncirus trifoliata (l.) raf. × c. sinensis (l.)) بررسی شد. رونوشت تمام طول برآمده از جدایۀ ایرانی cevds1 در شرایط درون شیشه‌ای‏ جهت آلوده‌سازی‏ مکانیکی نهال‌ها‏ استفاده شد. تنوع ژنتیکی جمعیت‌های‏ cevd با به‌کارگیری چندشکلی فضایی تک‌رشته‌ای‏ (sscp) و توالی‌یابی‏ نوکلئوتیدی تعیین شد. بررسی ژنوم ویروئید همسانه‏سازی‏شده در این دو میزبان، تاثیر گونۀ میزبان بر تغییرهای ژنتیکی جمعیت برآمده از یک جدایۀ cevd را آشکار کرد. نتیجه‏های این پژوهش نشان دادند که ساختار جمعیتی ویروئید اگزوکورتیس مرکبات در دو میزبان حساس و متحمل متفاوت و در میزبان متحمل متنوع‏تر از میزبان حساس است. بررسی ساختار ثانویۀ ترمودینامیکی واریانت‌ها‏ نشان داد که تغییرهای شناسایی‌شده در ژنوم ویروئید در این پژوهش تاثیر چشمگیری در ساختار کلی میله‌ای ‏‏شکل ویروئید نداشته است.

Progeny analysis of Iranian Citrus exocortis viroid isolate in two sensitive and tolerant rootstocks

Citrus exocortis viroid (CEVd) is the causal agent of exocortis disease, the economically important viroid disease of citrus. In this research, sequence polymorphism and population structure of CEVd were investigated in CEVd tolerant and sensitive hosts (sour orange (Citrus aurantium L.) and citrange (Poncirus trifoliata (L.) Raf. × C. sinensis (L.), respectively) seedlings. Fulllength in vitro transcript of single sequence CEVdS1 isolate was used for mechanical inoculation. The genetic diversity of CEVd populations was estimated in two citrus hosts by singlestrand conformation polymorphism (SSCP) and sequencing. The analysis of cloned DNAs recovered from infected hosts by this isolate demonstrated that host species was effective on the variability within a single CEVd isolate. The amount and composition of the genetic diversity were different among the two hosts, and was higher in the tolerant host compared with the sensitive one. Furthermore, the analysis of thermodynamic secondary structures illustrated that nucleotide changes identified in this study did not induce major modifications in the viroid rodlike secondary structure.