شناسایی مولکولی چهار ویروس مهم جنس نپوویروس از تاکستان‌های استان زنجان

به منظور بررسی وضعیت ویروس های مهم متعلق به جنس نپوویروس از تاکستان های استان زنجان، نمونه‌برداری در سال های زراعی 95-94 به‌صورت انتخابی از گیاهان دارای نشانه‌های مشکوک به بیماری‌های ویروسی انجام و درمجموع 168 نمونۀ گیاهی دارای نشانه و بدون نشانه گرد‌آوری شد. استخراج آر.ان. ای کل از بافت های برگی و آوندی 57 نمونه بر اساس نشانه‌ها و مناطق نمونه‌برداری شده انجام گرفت و cdna آن ها ساخته‌ شد و سپس، آزمون پی سی آر توسط آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر (افزونش) بخشی از ژنگان (ژنوم) نپوویروس‌های موزاییک آرابیس (arabis mosaic virus, armv)، بدشکلی انگور (grapevine deformation virus, gdev)، برگ بادبزنی انگور (grapevine fanleaf virus, gflv) و لکۀ حلقوی گوجه فرنگی (tomato ring spot virus, torsv) انجام گرفت. نتایج واکنش زنجیره ای پلمیراز گویای تکثیر قطعه‌های مورد انتظار از ویروس‌ های armv، gdev، gflv و torsv به ترتیب از 15.7، 15.7، 10.5 و 14 درصد نمونه ها بود. پس از تعیین توالی، همردیف‌سازی ترادف نوکئوتیدی قطعه‌های تکثیرشده با دیگر توالی‌های موجود در بانک ژن و تحلیل تبارزائی توسط برنامۀ mega6، با روش neighbor-joining انجام شد. بررسی رابطه‌های تبارزائی بر اساس توالی های نوکلئوتیدی نشان داد، جدایه های ردیابی شده در این تحقیق با جدایه هایی از کشورهای مختلف هم گروه‌اند که در بیشتر موارد ارتباط جغرافیایی بین جدایه‌های ردیابی شده و دیگر جدایه‌ها را نشان می‌دهد. این نخستین تحقیق جامع بر اساس داده های مولکولی از نپوویروس های مهم انگور در استان زنجان و نخستین گزارش ویروس بدشکلی انگور از این منطقه است.