بررسی چند شکلی ژن های PPARGC1A و OPN در گاوهای هلشتاین استان های تهران و اصفهان

چکیده ‏ppargc1a عضوی از خانواده فعال‏کننده های کمکی رونویسی می باشد که نقش اساسی در تنظیم متابولیسم انرژی ایفا می نماید. opn نوعی فسفو پروتیین است که در بافت ها و سلول های مختلف سنتز شده و در مایعات بدن ترشح می شود. در این مطالعه، استخراج dna از نمونه های خون جمع آوری شده از 398 راس گاو هلشتاین از استان های تهران و اصفهان انجام شد. برای استخراج dna از روش نمکی استفاده گردید. سپس snpt > c در موقعیت 1892 و snpa > c در موقعیت 3359 از ژن ppargc1a و نیز snpc > t در موقعیت 8514 از ژن opn به روش pcr-rflp تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرم افزار pop gene، فراوانی ژنوتیپ‏های tt، tc و cc در موقعیت نوکلیوتیدی 1892 به ترتیب 12، 65 و 23 درصد و همچنین شاخص‏ های شانون و ‏نیی به ترتیب 68/0 و 49/0 محاسبه شد. فراوانی ژنوتیپ های aa، acو cc در موقعیت نوکلیوتیدی 3359 به ترتیب 38، 52 و 10 درصد و همچنین شاخص‏های شانون و نیی به ترتیب 65/0 و 46/0 محاسبه شد. فراوانی ژنوتیپ های cc، ct و tt از ژن opn به ترتیب 19، 57 و 24 درصد و همچنین شاخص‏های شانون و نیی به ترتیب 69/0 و 49/0 محاسبه شد. با استفاده از آزمون مربع‏ کای، حالت تعادل برای جمعیت ها بررسی شد. ژنوتیپ ها در همه جایگاه ها از تعادل هاردی-واینبرگ انحراف نشان دادند.