تعیین توالی بخش HVS-I از ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندری جمعیتی از مرغ بومی مرندی و ترسیم رابطه فیلوژنی آن با سایر مرغان اهلی

چکیده نژاد های بومی مرغان اهلی در هر کشور به عنوان سرمایه ملی تلقی می شوند و حفظ آنها از نظر حفظ تنوع زیستی بسیار مهم می باشد. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها می تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در آن جمعیت را ارایه دهد. این تحقیق به منظور تعیین توالی بخش hvs-i از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری مرغ مرندی ایران انجام گرفت. استخراج dna از 15 قطعه مرغ خالص مرندی که به طور تصادفی انتخاب شده بودند، انجام شد و ناحیه hvs-i با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و قطعات تکثیر شده پس از کلون کردن توالی یابی شدند. از 15 نمونه اولیه در نهایت 10 توالی منفرد و یک توالی کلی بدست آمد. از تجزیه و تحلیل توالی های بدست آمده 6 هاپلوتیپ مشخص و توالی نمونه ها در پایگاه اطلاعاتی ncbi و با کدهای دسترسیgu481096 - gu481104 ثبت شدند. پس از اخذ توالی های مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای مرغ موجود در بانک جهانی ژن، درخت فیلوژنی با استفاده از توالی کلی بدست آمده ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغان بومی مرندی ایران با مرغ بومی کشور آذربایجان، پلیموت راک پر خط دار، لگهورن سفید، مرغ ابریشمی و مرغ جنگلی خاکستری (سونراتی) نزدیکی بیشتری دارد که این امر ممکن است به دلیل نزدیکی جغرافیایی زیستگاه نژاد مرندی و بومی کشور آذربایجان و همچنین مشابهت ژنتیکی مرغ مرندی ایران به نژادهای مدیترانه ای باشد.