ارزیابی فراوانی آللی مطلوب ژن عمده تحت تداخل و نبود تداخل نسل: مطالعه ای مبتنی بر شبیه سازی

یکی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند چندقلوزایی می باشد. این صفت تحت تاثیر بعضی از ژن ها با اثر بزرگ می باشد. هدف از مطالعه حاضر ارزیابی انواع طرح های انتخابی برای تثبیت آللی مطلوب ژن عمده در صفت چندقلوزایی تحت سناریوهای تداخل و نبود تداخل نسل بود. بدین منظور یک صفت چندقلوزایی با وراثت پذیری 0.1، متشکل از 26 کروموزوم و یک ژن عمده در جمعیت گوسفند شبیه سازی شد. ارزش اصلاحی حیوانات با استفاده از مدل آستانه ای بیزی پیش بینی شد. انتخاب حیوانات بر اساس ارزش اصلاحی (ebv)، فنوتیپی برتر (phen) و تصادفی (rnd) بود. پیشرفت ژنتیکی بعد از ده نسل انتخاب در طرح های انتخابی ebv، phen و rnd تحت سناریوی نبود تداخل نسل نسبت به سناریوی وجود تداخل نسل، به ترتیب 8، 23 و 26 درصد بیشتر بود. صحت ارزیابی در سناریوی تداخل نسل در مقایسه با سناریوی نبود تداخل نسل بیشتر بود. میانگین ضریب همخونی بعد از ده نسل انتخاب در سناریوی تداخل نسل برای طرح های انتخابیebv، phen و rnd به ترتیب 0.317، 0.029 و 0.027 و  برای سناریوی نبود تداخل نسل به ترتیب 0.327، 0.058 و 0.056 بود. در سناریوی نبود تداخل نسل فراوانی آللی مطلوب در طرح های انتخابی ebv، phen و rnd به ترتیب یک، 46 و 38 درصد نسبت به سناریوی تداخل نسل بیشتر بود. نتایج نشان داد که سناریوی نبود تداخل نسل با استفاده از طرح انتخابی ebv منجر به تثبیت آللی مطلوب ژن عمده و پیشرفت ژنتیکی بیشتری می شود.

evaluation of frequency of the favorable allele of major gene under overlapping and discrete generation: a study based on simulation

litter size (ls) is one of the important economic traits in sheep . this trait is influenced by some genes with a large effect. the purpose of this simulation study was to evaluate the fixation selection designs for favorable major gene allele under scenarios of overlapping and discrete generations. in this regard, a trait with heritability of 0.1, and a genome with 26 chromosomes and a major gene was simulated in sheep population. animals breeding value was predicted using bayesian threshold model. selection of animals was based on estimated breeding value (ebv), phenotype (phen) and random (rnd). after ten generations, genetic gain in selection based on ebv, phen and rnd under scenario of discrete generation were 8, 23 and 26 percent higher than those in scenario of overlapping generation, respectively. the accuracy of prediction in scenario of discrete generation was higher than scenario of overlapping generation. means of inbreeding coefficient under scenario of overlapping generation and selection for ebv, phen and rnd were 0.317, 0.029 and 0.027, respectively, and for scenario of discrete generation were 0.327, 0.058 and 0.056, respectively. in generation ten, the favorable allele of the major gene, in scenario of discrete generation selection based on ebv, phen and rnd was 1, 46 and 38 percent higher than those in the scenario of overlapping generation, respectively. the results indicated that the scenario of discrete generation selection based on ebv leads to more fixation the favorable allele of the major gene and of genetic gain.