|
|
ردیابی نشانههای انتخاب مثبت در نژادهای گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
یوسفی زهره ,بیگی نصیری محمدتقی ,مرادی محمد حسین ,عبداللهی آرپناهی رستم ,شیرعلی مسعود
|
منبع
|
علوم دامي ايران - 1396 - دوره : 48 - شماره : 4 - صفحه:593 -602
|
چکیده
|
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنومی) تحت انتخاب مثبت از بحثهای مهم در حوزۀ ژنتیک جمعیت است. هدف این تحقیق، شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان افشاری و مغانی است که تحت تاثیر انتخاب طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته اند. برای این منظور 75 راس گوسفند از دو نژاد افشاری (41 راس) و مغانی (34 راس)، با استفاده از آرایه های ژنگانیillumina ovine snp50k beadchip تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. برای ردیابی نشانه های انتخاب مثبت، از آزمون نااریب fst(تتا) در بستۀ نرم افزاری lokern در محیط r استفاده شد. نتایج این تحقیق منجر به شناسایی 16منطقۀ ژنگانی روی کروموزوم های 2، 3، 4، 8، 9، 13، 15، 22 و 26 شد که هدف انتخاب های مثبت در این نژادها قرارگرفته بودند. بیشتر این ژن ها در مسیر های انتقال سیگنال در طیف گسترده ای از فرآیند های سلولی و بیوشیمیایی نقش داشتند. بهویژه، نشانه های انتخاب پوشانندۀ چندین ژن که بهطور مستقیم یا غیر مستقیم بر فرآیند های تجمع رنگدانه در پوست (edn3، bnc2)، ریختشناختی (مورفولوژی) اسکلت یا ساختار و اندازۀ بدن (bmp2، ext2،alx4)، تنظیم سوختوساز (ppp1r3d) و پاسخ ایمنی (il2rb) مرتبط بودند، شناسایی شدند. مکان های ژنی شناسایی شده نشان می دهد که انتخاب های انجام شده در فرآیند و روند تکامل و سازگار شدن با محیط و شرایط جغرافیایی متفاوت، منجر به تفرق جمعیتی نژادهای افشاری و مغانی شده است. بنابراین، نتایج بهدستآمده از این تحقیق می تواند نقش مهمی در ردیابی مناطق ژنگانی مرتبط با صفات پدیدگانی (فنوتیپی) متمایزکنندۀ این دو نژاد بومی داشته باشد.
|
کلیدواژه
|
ژنهای کاندید، شاخص تمایز جمعیتی، گوسفند افشاری، گوسفند مغانی، نشانۀ انتخاب
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه اراک, دانشکدۀ کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس ابوریحان, ایران, دانشگاه ادینبرو, مرکز علوم بالینی مغز, انگلستان
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Tracking signatures of positive selection in Iranian Afshari and Moghani Sheep breeds using genomic data
|
|
|
Authors
|
Yousefi Zohre ,Beige Nasiri Mohammad Taghi ,moradi mohammad hosein ,Abdollahi Arpanahi Rostam ,Shirali Masoud
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|