|
|
شناسایی نواحی تحت انتخاب مثبت در ژنگان اسبهای کرد و عرب ایرانی با استفاده از روش مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مقصودی صابر محمد ,مهربانی یگانه حسن ,نجاتی جوارمی اردشیر
|
منبع
|
علوم دامي ايران - 1397 - دوره : 49 - شماره : 2 - صفحه:321 -333
|
چکیده
|
اسب های عرب به داشتن عملکرد خوب در مسابقههای استقامتی، پرش و زیبایی شهرت دارند. اسب های کرد بومی منطقههای کوهستانی غرب ایران، مناسب مسابقههای چوگان هستند. اسب های کرد، قد کوتاه تر و وزن سنگین تری نسبت به اسب های عرب دارند. در این بررسی آمارۀ xp-ehh که مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی (لینکاژی) است برای شناسایی قطعههای کروموزومی تحت انتخاب در ژنگان (ژنوم) اسب های کرد و عرب ایرانی استفاده شد. برای این منظور، از نمونۀ خون و مو 38 اسب عرب و 58 اسب کرد dna ژنگانی استخراج شد. همۀ نمونه ها dna توسط آرایۀ axiom mnec670 تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. پس از پالایش دادهها آمارۀ xp-ehh محاسبه شد. در اسب های عرب 51 جایگاه (85 ژن) و در اسبهای کرد 7 جایگاه (13 ژن) تحت انتخاب شناسایی شد. نواحی تحت انتخاب در اسب های عرب با مسیرهای درگیر در سامانۀ ایمنی، تشکیل پروتئین شیر، رشد و نمو و سوختوساز (متابولیسم) ماهیچه، بینایی، شبکۀ عصبی و اندازۀ بدن مرتبط بودند درحالیکه در اسب های کرد با مسیر گیرندۀ جفتشونده با پروتئین g، رشد و بلوغ فیبرهای ماهیچه، تنظیم خون بندآوری (هموستازی) اکسیژن یاختهای، رنگدانه سازی در پوست و مو ارتباط داشتند.
|
کلیدواژه
|
اسب عرب ایرانی، نژاد اسب کرد، نشانههای انتخاب
|
آدرس
|
دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Identification of positive selection signatures in Iranian Kurdish and Arabian horses by linkage disequilibriumbased method
|
|
|
Authors
|
Maghsoodi Saber Mohammad ,Mehrabani Yeganeh Hassan ,Nejati Javaremi Ardeshir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|