مدل‌سازی شبکۀ‌ ژنی و کاوشگری در برخی از بافت‌های گونۀ گاو با استفاده از داده‌های ریزآرایۀ Dna

هدف از این پژوهش، شناسایی ژن‌ها و کاوشگرهای هاب ناشی از ایجاد شبکه‌های بیزی در داده های بیان ژن  و کاوشگری در بافت‌های مختلف گونۀ گاو با استفاده از داده‌های ریزآرایۀ dna بود. با استفاده از داده های خام بیان ژن و کاوشگری در هر بافت، ژن‌ها و کاوشگرهایی که عامل بیشترین میزان واریانس بیان ژن بودند، شناسایی‌شده و سپس شبکۀ بیزی، برای آن‌ها برازش داده شد. ژن ها و کاوشگرهای هاب با استفاده از نسبت فراسنجه های درجۀ درون و بیرون شناسایی شدند. اندازۀ پوشش مارکفی در شبکه های مختلف متفاوت بود که به‌احتمال بیانگر وجود زیرساختارهای ساختارشناختی (توپولوژیکی) برای شبکه های یادشده در بافت های مختلف است. در روش شبکۀ ژن محور ، در بافت ماهیچۀcbr1 ،loc788826 ، در بافت پستانیnid2 ، col5a2، loc616942،fxyd3 ، در بافت کبدی loc100132279،mgc127133 ، mboat2،cldn2 ، ankrd1، در بافت رحم igfbp1، dgat2، ckmt1، isg15، ckmt1 و در بافت تخمدانloc286871  وinhba  به‌عنوان ژن‌های هاب شناسایی شدند. هم چنین در روش ایجاد شبکۀ کاوشگر محور، مشخص شد که دو ژن jsp.1 و bola-dqb در بافت های کبد و رحم فعال هستند. ولی این ژن ها در روش ژن محور در ایجاد شبکۀ ژنی به‌عنوان ژن هاب استخراج نشدند.