برآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت‌های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم

هدف از این پژوهش برآورد صحت ارزش های اصلاحی ژنگانی با استفاده از مدلgblup (genomic best linear unbiased prediction) و مقایسۀ آن با روش سنتی با (blup) و بدون شجره (blup_noped) به وسیله همانندسازی رایانه ای بود. در این تحقیق، ژنگانی با سی جفت کروموزوم به‌گونه‌ای همانند سازی شد که شمار qtlها 3000 و شمار نشانگرها (snp) 45000 جایگاه در نظر گرفته شدند. همچنین پیش‌فرض های مختلف شامل دو جمعیت موثر 100 و 1000 راسی، دو جمعیت مرجع 1000 و 2000 راسی و مقادیر وراثت‌پذیری پایین (0/05)، متوسط (0/30) و بالا (0/05) بررسی شد و برای مقایسۀ مدل ها از معیارهای صحت، اریبی و میانگین مربعات خطا استفاده گردید. نتایج نشان داد، با افزایش وراثت‌پذیری، صحت ارزش های اصلاحی در روش های سنتی و ژنگانی افزایش یافت؛ در همۀ پیش‌فرض‌ها مدل gblup صحت بیشتری نسبت به مدل blup_noped داشت؛ اما روش ژنگانی عملکرد بهتری در وراثت پذیری بالاتر نسبت به روش سنتی blup داشت. افزایش جمعیت موثر از 100 به 1000 منجر به کاهش صحت ارزش های اصلاحی ژنگانی به میزان 11درصد شد؛ ولی تاثیری بر صحت ارزش های اصلاحی روش های سنتی نداشت. اما با افزایش جمعیت مرجع از 1000 به 2000 حیوان نسبت بهبود صحت ارزش های اصلاحی ژنگانی به میزان 5درصد بهبود یافت. اگرچه در همۀ پیش‌فرض‌های اریبی (کم برآورد) روش ژنگانی نسبت به روش های سنتی بیشتر بود؛ امّا با افزایش اندازۀ جمعیت مرجع و وراثت پذیری، میانگین مربعات خطا در روش ژنگانی نسبت به روش سنتی blup کاهش یافت. بنابراین مدل gblup می تواند برای انتخاب حیوانات برتر در جمعیت‌های بدون شجره استفاده شود.