|
|
پویش ژنگانی نشانههای انتخاب مرتبط با بیماری ورم پستان در گاو هلشتاین آلمانی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عباسی مشایی بیتا ,رحیمی میانجی قدرت الله ,نجاتی جوارمی اردشیر ,مرادی محمد حسین ,کونیگ سون
|
منبع
|
علوم دامي ايران - 1396 - دوره : 48 - شماره : 3 - صفحه:453 -461
|
چکیده
|
اهلی سازی و انتخاب بهشدت در ویژگیهای ظاهری و رفتاری حیوانهای اهلی امروزی تغییر ایجاد کرده است. در این مسیر انتخاب های انجامشده توسط انسان نشانه های قابل شناسایی را در ژنگان (ژنوم) گاوهای امروزی به جا گذاشته که آشکار سازی این نشانه ها می تواند به اصلاح و بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در این دامها کمک کند. امروزه بیماری ورم پستان یکی از مهمترین چالش های اقتصادی در صنعت گاو شیری است که بهطور عمده به دلیل انتخاب گسترده در دهه های اخیر برای افزایش تولید شیر به وجود آمده است. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنگانی مرتبط با ورم پستان، از اطلاعات طرح ملی گاو شیری هلشتاین آلمان استفاده شد. نمونه ها با استفاده از آرایه های illumina bovine 50k snp تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. 133 راًس دام بیمار و 133 راًس دام سالم بر پایۀ اطلاعات ثبتشده در رابطه با ابتلا به ورم پستان در نخستین دورۀ شیردهی برای جستجوی نشانه های انتخاب با استفاده از آمارۀ تمایز جمعیتی تتا انتخاب شدند. با در نظر گرفتن صدک 99.9 کل ارزش های تتا، ده ناحیۀ ژنگانی روی کروموزوم های 1 (2 ناحیه)، 3، 5، 6، 14 (2 ناحیه)، 21 (2 ناحیه) و 28 شناسایی شد. بررسی های بیشتر دادههای زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، ژن های موجود در این مناطق با سامانۀ ایمنی و بیماری های خود ایمنی، شبکۀ عصبی، انواع سرطان از جمله سرطان پستان و تولید شیر مرتبط هستند. در مجموع، نتایج این تحقیق می تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی درزمینۀ شناسایی مناطق ژنگانی و درنتیجه ژن های مرتبط با ورم پستان در گاو شیری فراهم آورد.
|
کلیدواژه
|
آزمون تتا، گاو هلشتاین آلمانی، نشانههای انتخاب، ورم پستان
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه تهران, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه اراک, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه کاسل, گروه علوم دامی, آلمان
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genomic scan for selection signatures associated with mastitis in German Holstein cattle
|
|
|
Authors
|
Abbasi Moshaii Bita ,Rahimi-Mianji Ghodrat ,Nejai-Javaremi Ardeshir ,Moradi Mohammad hosein ,Konig Sven
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|