|
|
فراتحلیل (متاآنالیز) دادههای بیان ژن بافت پستان آلودهشده با باکتری اشریشیاکلی در گاوهای شیری
|
|
|
|
|
نویسنده
|
شریفی سمیه ,پاکدل عباس ,ابراهیمی اسماعیل
|
منبع
|
علوم دامي ايران - 1396 - دوره : 48 - شماره : 3 - صفحه:343 -352
|
چکیده
|
تشخیص ژنهای درگیر در صفات پیچیده مانند حساسیت به بیماری نه تنها میتواند موجب بهبود تشخیص و پیشگیری از بیماری مورد نظر میشود، بلکه در انتخاب راههای درمانی کارآمد و همچنین در انتخاب دامهای مقاوم به اصلاحگران کمک خواهد کرد. در این تحقیق با هدف بالا بردن توان تجزیۀ آماری در شناسایی ژنها و مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) درگیر در بیماری ورم پستان، از فراتحلیل به روش fisherبرای یکی کردن pvalueهای بهدستآمده از تجزیۀ انفرادی دادههای شش بررسی ریزآرایه که بیان ژن بافت پستان هنگام درگیری با باکتری اشریشیاکلی (e. coli) در گاوهای شیری را بررسی کرده بودند، استفاده شد. شناسایی ژنهایی که در هیچیک از بررسیهای انفرادی معنی دار نشده بودند می تواند تاییدکنندۀ هدف بیان شده باشد که منجر به ارائۀ مجموعۀ کاملتری از مسیرهای زیستی مرتبط با سامانۀ ایمنی، التهاب، تجزیۀ پروتئین (پروتئولیز) و مسیرهای مرتبط با رشد و افزونش و مرگ یاختهای شد.کنترل مثبت بیان پروموتور rna پلیمراز iiمسیر جدیدی در رابطه با این بیماری است که با وجود در بر گرفتن بیشترین شمار ژن در این بررسی، در بررسیهای گذشتۀ مرتبط با ورم پستان گزارش نشده است.
|
کلیدواژه
|
آنتولوژی ژن، اشریشیاکلی، تفاوت بیان ژن، گاو شیری، ورم پستان
|
آدرس
|
دانشگاه صنعتی اصفهان, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه صنعتی اصفهان, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه شیراز, گروه بیوتکنولوژی, ایران. دانشگاه آدلاید, گروه تحقیقاتی, استرالیا
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Metaanalysis of transcriptomic data of mammary gland infected by Escherichia coli Bacteria in dairy cows
|
|
|
Authors
|
Sharifi Somayeh ,Pakdel Abbas ,Ebrahimie Esmaeil
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|