|
|
همسانه سازی، شناسایی و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و روند تکامل ژنتیکی یک ژن تیوردوکسین h از گیاه انگور بیدانه سفید
|
|
|
|
|
نویسنده
|
حیدری چابقلی رضا ,حداد رحیم ,گروسی قاسمعلی
|
منبع
|
علوم باغباني ايران - 1391 - دوره : 43 - شماره : 2 - صفحه:161 -174
|
چکیده
|
تیوردوکسین ها (trxs) پروتیین هایی کوچک و مقاوم در برابر حرارت هستند که در حفظ تعادل شرایط اکسیداسیون- احیا (redox) سلولی دخالت داشته و در تمام موجودات زنده از پروکاریوت ها تا یوکاریوت های عالی وجود دارند. در گیاهان عالی، تیوردوکسین ها به شش گروه مختلف، شامل تیوردوکسین های کلروپلاستی f،m ،x و y، تیوردوکسین میتوکندریایی o و تیوردوکسین های h تقسیم بندی می شوند. تیوردوکسین های h با داشتن یک خانواده چند ژنی کوچک در فرآیندهای متعددی از جمله محافظت سلولی در برابر تنش اکسنده دخالت می کنند. cdna کدکننده ژن تیوردوکسین h (vvtrxh3) از بافت برگ گیاه انگور بیدانه سفید (vitis vinifera l. bidaneh sefid)، با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز نسخه برداری معکوس (rt-pcr) جداسازی و همسانه سازی شده و خصوصیات بیوشیمیایی، ساختاری و روند تکامل ژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. بررسی توالی نوکلیوتیدی نشان داد که چارچوب باز خواندنی ژن همسانه سازی شده vvtrxh3 به طول bp345 بوده و یک پروتیین با 114 اسیدآمینه را کد می کند. همچنین بررسی توالی پروتیینی این ژن نشان داد که جایگاه فعال آن به صورت wcgpc بوده و وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه آیزوالکتریک پیش بینی شده آن به ترتیب برابر 79/12 کیلودالتون و 06/5 و دارای ساختار سه بعدی مختص پروتیین های تیوردوکسین، تحت عنوان thioredoxin fold می باشد. بررسی های فیلوژنتیکی و همردیف سازی چندگانه نشان داد که این ژن، تیوردوکسین نوع h و متعلق به زیرکلاس ia از زیرگروه i بوده و شباهت زیادی با تیوردوکسین های h گیاهان دیگر دارد.
|
کلیدواژه
|
تیوردوکسین ردوکتاز ,تنش اکسنده ,شاخص آب گریزی
|
آدرس
|
دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره), دانشجوی کارشناسی ارشد, ایران, دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره), دانشیار, ایران, دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره), استادیار, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|