شناسایی آلل‌های خودناسازگاری برخی از ژنوتیپ‌های بادام استان یزد با استفاده از روش ‏pcr

یکی از مشکلات تولید بادام، خودناسازگاری در این گیاه بوده که از نکات مهم اصلاحی این گیاه تلقی می‌شود. خودناسازگاری در بادام باعث غیر یکنواختی زمان برداشت، مشکلات مربوط به گرده‌افشانی و بروز مشکلاتی در مدیریت باغ خواهد شد. اغلب ارقام بادام دارای خودناسازگاری از نوع گامتوفتیکی هستند که توسط یک مکان ژنی چند آللی کنترل می‌شود. عامل بازدارنده لقاح گل در این پدیده توقف رشد لوله گرده در میانه خامه می باشد. هدف از این تحقیق شناسایی و تعیین آلل های مربوط به خودناسازگاری در ژنوتیپ‌های بادام در استان یزد بوده است. در این تحقیق، ژنوتیپ‌های برتر بادام جمع آوری و پس از استخراجdna  برای تشخیص آلل های s جفت آغازگرهای اختصاصی as1iiamyc5r،confconr  و cebador2cebador8 مورد استفاده قرار گرفت. در واکنش زنجیره ای پلیمراز جفت آغازگر as1iiamyc5r و cebador2cebador8 به ترتیب باندهایی به اندازه 1205 و 1200 جفت بازی برای آلل sf تشکیل گردید. لازم به ذکر است ارقام خودسازگار از تلاقی تونو با ترکیب آللی s1sfبه‌عنوان والد پدری و خودسازگار و آیدین با ترکیب آللی s1s23به‌عنوان والد مادری و خودناسازگار به‌دست‌آمده است. با استفاده از جفت آغازگر confconr آلل های s1، s2، s3، s10، s11، s23 و s31در نمونه های خودناسازگار شناسایی شدند. در این تحقیق آلل های sf، s3، s2، s1، s5، s10،s11، s23 و s13با استفاده از جفت آغازگر as1iiamyc5r شناسایی شدند. بر اساس نتایج به‌دست‌آمده  آلل های s1، s2، s3 و s11  دارای بیشترین فراوانی و آلل‌های s5، s23، s10، s13وs31 به ترتیب کمترین درصد فراوانی را نشان دادند.

Identification of selfincompatibility alleles in some of Yazd province almond ‎genotypes by using PCR method‏ ‏

One of the problems in almond production is selfincompatibility in this plant, which is considered as an important point of breeding. Selfincompatibility causes nonuniformity of harvesting time as well as some of garden management and pollination problems. Most cultivars of almonds have gametophytic selfincompatibility that is controlled by a multiallelic gene locus. The fertilization inhibitor factor in this phenomenon, pollen tube growth stops in the middle of the style. The purpose of this research was identification and determination of the selfcompatible genotype in the Yazd province.in this investigation better genotypes of almond were collected and after DNA extraction was done, in order to detect S alleles in different almond and some hybrid genotypes, the specific primer pairs, including AS1IIAmyC5R, ConFConR and Cebador2Cebador8, were used in the polymerase chain reaction. In polymerase chain reaction, using the AS1IIAmyC5R and Cebador2Cebador8 primers, the Sf allele with the size of 1200 base pairs was detected. Using the ConFConR pair of primer, the S1, S2, S3, S10, S11, S23, and S31 alleles were detected in the selfincompatible samples. Using AS1IIAmyC5R pair of primer, the known alleles of S3, Sf, S2, S1, S5, S10 S11 S23, and S13 were detected. The other bands obtained from the PCR were related to the known selfincompatibility alleles that might be considered as new alleles.  According to the obtained results, S1, S2, S3, and S11alleles had the highest frequency and S5, S23, S10, S13and S31alleles respectively had the lowest frequency.