شناسائی گونه‏های تریکودرما با استفاده از توالی‏یابی جزئی ژن‏های nrrna و tef1α همراه با معرفی trichoderma capillare برای میکوفلور ایران

گونه‏های تریکودرما به فراوانی در خاک‏های کشاورزی یافت می‏شوند و اغلب آن‏ها بعنوان عامل بیوکنترلی علیه بیمارگرهای گیاهی عمل می‏کنند. آن‏ها همچنین بعنوان تولید‏کننده‏های صنعتی آنزیم‏ها شناخته می‏شوند. با توجه به اهمیت این قارچ، شناسائی صحیح آن‏ها در سطح گونه ضروری می‏باشد. شناسائی گونه‏ها مبتنی بر خصوصیات ریخت‏شناسی با توجه به هموپلاسی زیاد در صفات ظاهری مناسب نمی‏باشد. در این تحقیق، 40 جدایه‏ تریکودرما از استان‏های اصفهان، اراک و همدان با استفاده از توالی‏یابی جزئی ژن‏های nrrna و tef1α شناسائی شد. جدایه‏ها در محیط pdb کشت شد و توده میسیلیومی با استفاده از کاغذ صافی جمع‏آوری شد. میسیلیوم‏ها در لیوفیلیزر خشک‏انجمادی و سپس از آن استخراج dna شد. واکنش زنجیره‏ای پلی‏مراز جهت تکثیر حدود 550 و 900 جفت باز بترتیب از نواحی its و tef1α با استفاده از آغازگر‏های عمومی و تخصصی انجام شد. قطعات تکثیری توالی‏یابی شد و بعد از ویراستاری و جستجو با استفاده از الگوریتم blastn، در بانک ژن ذخیره گردید. بر اساس صفات ریخت‏شناسی و آنالیز توالی‏های نوکلئوتیدی its و tef1α، جدایه‏ها در هفت گروه گونه‏ای شامل trichoderma harzianum، t. capillare ، t. pleuroticola، t. asperellum، t. koningiopsis، t. brevicompactum و t. virens توزیع شدند. درخت فیلوژنتیکی این جدایه‏ها با استرین‏های مرجع تیپ بر اساس توالی tef1α ترسیم شد که در آن خوشه‏بندی فیلوژنتیکی تولید شده اصالت گونه‏ای جدایه‏های مورد بررسی را تایید کرد. این اولین گزارش گونه t. capillare برای میکوفلور ایران است.