بررسی تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنتیکی جدایه‌های polymyxa betae keskin در مزارع چغندرقند استان‌های خراسان رضوی و شمالی با استفاده از مکان‌های بین ژنی (its)

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنتیکی جدایه‌هایpolymyxa betae از خاک 49 مزرعه چغندرقند استان خراسان رضوی و شمالی نمونه‌برداری شد. سپس در خاک‌های جمع آوری شده بذر چغندر قند رقم ic کاشته شد و بعد از 5 الی 7 هفته، dna کل ریشه چغندرقند استخراج شد و منطقه 463 جفت بازی از قارچ p.betae شامل18s r rna، its1، 5.8srrna، its2 و28s rrna با استفاده از جفت آغازگرهای pxfwd1/its4 تکثیر شدند. بیست و دو جدایه از گونه فوق انتخاب و توالی‌یابی گردیدند. توالی‌های به‌دست آمده با 5 توالی از بانک ژن(ncbi) مقایسه شدند. بر طبق این آزمایش، جدایه‌های قارچ مزبور در دو گروه قرار گرفتند. جدایه‌های مناطق مختلف استان‌های خراسان رضوی و شمالی، در یک گروه و با شباهت ژنتیکی بسیار نزدیک به یکدیگر و جدایه‌های اروپایی در گروه جداگانه‌ای قرار گرفتند. نتایج این تحقیق حاکی از آن است که منطقهits2 نسبت به منطقه its1 در آنالیز فیلوژنی این جنس مناسب‌تر می‌باشد.