نخستین بررسی ویروئید پوست پینه‏ای سیب در میزبان‌های سیب و گلابی در ایران و تعیین میزان تنوع ژنتیکی جدایه‏های ایرانی

ویروئید پوست پینه‏ای سیب، assvd(apple scar skin viroid)، یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های ویروئیدی در میان درختان میوه دانه‏دار بوده و میتواند خسارات اقتصادی چشم‌گیری ایجاد نماید. علایم این بیماری شامل شکاف خوردگی، بدشکلی و خال‌دار شدن میوه در باغات سیب و گلابی در استان خراسان رضوی مشاهده گردید. نمونه‌برداری از باغات سیب و گلابی صورت گرفته و rna از برگ‌های درختان با استفاده از روش به دام اندازی سلیکا (silica capture method) استخراج گردید. assvd پس از انجام آزمون rt-pcr در نمونه‌های حاصل از این باغات شناسایی شد. محصول pcr خالص گردیده و با استفاده از ناقلpgem®-t easy همسانه‏سازی شده و پلاسمید نوترکیب حاصل توالی یابی شد. پس از انجام آنالیزهای لازم، 12 جدایه جدید این ویروئید از میزبان‌های سیب و گلابی در بانک ژن (ncbi) ثبت گردید. این جدایه‏ها‏ طولی بین 334 -329 نوکلئوتید داشتند. آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor joining نشان داد که جدایه‏های ایرانی از سایر جدایه‏های این ویروئید مشخص بوده و در گروه جداگانه‏ای قرار گرفتند. تنوع ژنتیکی از طریق نشان دادن جایگاه‌های جهش جدایه‏های ایرانی بر روی ساختار ثانویه مولکول مرجع assvd مورد بررسی قرار گرفت. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی و بررسی صفات ویروئید پوست پینه‏ای سیب در ایران میباشد.