|
|
پیشبینی برهمکنش بین ترکیبات موجود در برهموم زنبور عسل و بخش آنتیژن حفاظتکننده موجود در سم سیاه زخم با استفاده از نرمافزارهای بیوانفورماتیک
|
|
|
|
|
نویسنده
|
محمدی المیرا ,گوانجی شاهین ,خزیمه فائزه ,گلستاننژاد زهرا ,گلستاننژاد محمدرضا ,بخشی مهین ,یوسف شاهی هژیر ,دوست محمدی محسن
|
منبع
|
مجله دانشكده پزشكي دانشگاه علوم پزشكي تهران - 1395 - دوره : 74 - شماره : 10 - صفحه:715 -722
|
|
|
چکیده
|
زمینه و هدف: آنتی ژن حفاظت کننده از بخش های ساختاری در یکی در سم سیاه زخم می باشد و پس از تاثیر سم برگیرنده سلولی، نقش مهمی در بیماری زایی سم ایفا می کند. هدف از این مطالعه بررسی برهمکنش بیوانفورماتیکی آنتی ژن حفاظت کننده سیاه زخم و چهار ترکیب مهم موجود در بره موم زنبور عسل شامل کافئیک اسید، ﺑﻨﺰیﻞ کافئات، سینامیک اسید و کامپفرول با استفاده از نرم افزارها و وبگاه های بیوانفورماتیکی بود.روش بررسی: این پژوهش با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های بیوانفورماتیکی در سال 1393 در دانشگاه علوم پزشکی اصفهان و دانشگاه آزاد اسلامی واحد خوراسگان انجام گرفت. برهمکنش گیرنده با هر کدام از لیگاندها، با استفاده از وب سرورهای swissdock (http://www.swissdock.ch/) و bspslim (http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/bspslim/) به دست آمد. نتایج داکینگ (docking) به صورت عدد بر حسب کیلوکالری بر مول (kcal/mol) مشخص شد.یافته ها: بررسی برهمکنش ترکیبات موجود در بره موم و آنتی ژن خفاظت کننده با استفاده از سرور bspslim نشان داد که بیشترین برهمکنش به ترتیب مربوط به ترکیبات کافئیک اسید، ﺑﻨﺰیﻞ کافئات، سینامیک اسید و کامپفرول بود. نتایج مربوط به برهمکنش لیگاندهای مورد نظر و آنتی ژن حفاظت کننده با استفاده از سرور swissdock نشان داد که ترکیب کافئیک اسید، delta;g برابر با kcal/mol 10/9 و fullfitness برابر با kcal/mol 16/993 داشت. بررسی و تحلیل برهمکنش لیگاندها با آمینواسیدهای وآنتی ژن حفاظت کننده نشان داد که بیشترین برهمکنش در ترکیب کافئیک اسید مربوط به اسید آمینه گلوتامیک اسید 117 با انرژی برابر با kcal/mol 5429/15 بود.نتیجه گیری: گلوتامیک اسید 117 در اتصال آنتی ژن حفاظت کننده و گیرنده سلولی آن و در پی آن بیماری زایی سم تاثیر چشمگیری دارد.
|
کلیدواژه
|
سم سیاه زخم، آنتیژن حفاظتکننده، برهموم، کافئیک اسید، برهمکنش مولکولی
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده داروسازی, گروه بیوتکنولوژی دارویی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد اصفهان (خوراسگان), باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده دندانپزشکی، مرکز تحقیقات دندانپزشکی, گروه بیماریهای دهان فک و صورت, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده دندانپزشکی، مرکز تحقیقات دندانپزشکی, گروه بیماریهای دهان فک و صورت, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده پزشکی، بیمارستان عیسی ابن مریم, گروه ارتوپدی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی, دانشکده دندانپزشکی, گروه بیماریهای دهان فک و صورت, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده دندانپزشکی, کمیته پژوهشهای دانشجویان, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد اصفهان (خوراسگان), باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Forecasting of interaction between bee propolis and protective antigenic domain in anthrax using the software and bioinformatics web servers
|
|
|
Authors
|
Mohammadi Elmira ,Khozimeh Faezeh ,Yousefshahi Hazhir ,Bakhshi Mahin ,Golestannejad Mohammadreza ,Doostmohammadi Mohsen ,Gavanji Shahin ,Golestannejad Zahra
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|