ارتباط بین پلی‌مورفیسم ژنی Rs1676486 و ریسک ابتلا به دژنراسیون دیسک کمر در جمعیت ایرانی

زمینه و هدف: دژنراسیون دیسک کمر یک بیماری تخریبی و پیش‌رونده ستون فقرات است که تحت تاثیر فاکتورهای ژنتیک و محیطی قرار می‌گیرد. قسمت عمده دیسک کمر از ماتریکس خارج سلولی و بافت غضروفی تشکیل شده است که کلاژن نوع xi در ساخت آن شرکت دارد. rs1676486 یک singlenucleotide polymorphism (snp) است که منجر به تبدیل ct شده در نتیجه تغییر در بیان زنجیره آلفا 1 کلاژن 11رخ می‌دهد. الل t منجر به کاهش رونوشت زنجیره آلفا 1 کلاژن 11 شده و در نهایت منجر به عدم تعادل در بیان ژن می‌شود.روش بررسی: در این مطالعه شاهدکنترل 100بیمار که در فاصله زمانی فروردین 1395 تا شهریور 1396به بیمارستان الزهرا اصفهان مراجعه کردند، به‌همراه 100 فرد سالم وارد مطالعه شدند. جهت تعیین ژنوتیپ افراد از تکنیک high resolution melting (hrm) استفاده شد. سپس به‌منظور بررسی شناسایی تفاوت ژنوتیپ و توزیع آلل بین دو جمعیت بیمار و کنترل از fisher rsquo;s exact test و chisquare test استفاده و برای مقایسه بین ژنوتیپ و ویژگی‌های کلینیکی بیماران از mann whitney u test استفاده شد.یافته‌ها: نتایج مطالعات نشان‌دهنده این می‌باشد که rs1676486 در ژن زنجیره آلفا 1 کلاژن 11منجر به تغییر بیان ژن در سن کمتر از 50 سال شده و باعث افزایش ریسک ابتلا به دژنراسیون دیسک کمر در بیماران با سن بیش از 50 سال می‌شود. بیماران با فراوانی ژنوتیپ aa بیش‌تر از کنترل بوده و rs1676486 منجر به افزایش ابتلا به دژنراسیون دیسک کمر می‌شود.نتیجه‌گیری: این مطالعه نشان داد که بیان کلاژن xi با سن و فاکتور ژنتیک در بیماران دژنراسیون دیسک کمر ارتباط دارد.

Association of Rs1676486 genetic polymorphism and lumbar disc degeneration in Iranian population

Background: lumbar disc degeneration is a multifactorial degenerative disease which is affected by genetic inheritance and environmental factors. Type XI collagen is important for organization of the extracellular matrix and cartilage collagen construction. Rs1676486 is a SNP that causes the conversion of CT, resulting in a change in the expression of the collagen 11 alpha chain. The T allele reduces the alpha 1 chain transcription of collagen 11 and ultimately leads to an imbalance in gene expression.Methods: This study aims to determine the genetic variant of alpha1 type11 collagen is associated with the progress of intervertebral disc degeneration. All patients were selected from the ALZahra Hospital of medical university of Isfahan, Iran, between April 2016 and September 2017. SNP rs1676486 of alpha1 type11 collagen was genotyped in 100 patients and 100 healthy controls. The inclusion criteria for patients were: individuals who had typical clinical and imaging symptoms and signs of intervertebral disc degeneration. Exclusion criteria were: patients with trauma, metabolic and neuromuscular diseases, and congenital disorder of the spine. The Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples by a Whole Blood Genomic DNA Extraction Kit. The chisquare test and fisher rsquo;s exact test were evaluated to determine differences of genotype and allele distributions between intervertebral disc degeneration patients and healthy controls. To compare the relationship between genotypes and clinical features the MannWhitney U test was used.Results: The mean age was 39.54 ±9.52 years for the patients and 28.14 ±5.32 years for the controls, respectively. The mean BMI were 26.3 ±3.18 kg/m2 and 27.3 ±3.52 kg/m2 for the patients and the controls, respectively. In addition, the results showed that the prevalence of surgical disc in patients with L4L5 levels was 52.1% and L5S1, with 31.1%. This study showed, rs1676486 in alpha1 type11 collagen gene was associated with modified intervertebral disc degeneration at age le;50 years and this gene increases intervertebral disc degeneration risk at age >50 years. SNP rs1676486 had the significant association with the intervertebral disc degeneration (P=0.019), and patients were found to have higher frequency of AA than the controls.Conclusion: This observation shows that type XI collagen is related to age and genetic factor in intervertebral disc degeneration disease.