متیلاسیون اگزون 1، ژن cdkn2a در نمونه‌های بلوک پارافینه سرطان روده بزرگ

زمینه و هدف: امروزه پژوهش های مولکولی نشان می دهد که بعضی از ژن ها در ناحیه پروموتر خود به صورتی متحمل متیلاسیون می شوند که باعث خاموشی یا کاهش بیان ژن های دخیل در مسیرهای رشد سلولی می شود. تشخیص موقعیت متیلاسیون می تواند به عنوان مارکری برای تشخیص سرطان و پیش بینی بیماری باشد. ژن سرکوب گر تومور cdkn2a پروتیینی را رمزگذاری می کند که در مهار cdk4/6 و کاهش سطح فسفریلاسیون پروتیین رتینوبلاستوما (prb) نقش دارد. هدف این مطالعه، بررسی مولکولی هیپرمتیلاسیون اگزون 1، cdkn2a در افراد دارای سرطان کولورکتال و افراد سالم بود. روش بررسی: این مطالعه مورد شاهدی که جمعیت مورد مطالعه آن شامل 20 فرد مبتلا به سرطان کولورکتال و 10 فرد سالم بودند. نمونه ها به صورت بلوک پارافینه، از دی 1389 تا خرداد 1391 از بخش پاتولوژی بیمارستان مهر تهران تهیه گردید. سپس برای حالت های متیله و غیرمتیله ژن cdkn2a، آغازگر اختصاصی طراحی شد، به منظور بررسی سطح متیلاسیون اگزون 1، ژن cdkn2a از روش pcr اختصاصی متیلاسیون (msp) استفاده گردید. یافته ها: در این مطالعه، هایپرمتیلاسیون اگزون 1، ژن cdkn2a در بافت توموری 80% (16 نمونه) و در بافت سالم 20% (دو نمونه) مشاهده گردید. در بیمارانی که سن آنها بیشتر از 50 سال بود متیلاسیون ژن cdkn2a با فراوانی بیشتری نسبت به بیمارانی با سن کمتر از 50 سال مشاهده گردید (66% در برابر 34%) (p<0.001). نتیجه گیری: نتایج این آزمایش نقش هایپرمتیلاسیون نواحی cpg پروموتر ژن cdkn2a در بافت توموری را به عنوان عامل ایجاد کننده سرطان کولورکتال در انسان تایید نمود و می توان به عنوان یک مارکر در تشخیص زود هنگام بیماری و شناسایی افراد مستعد استفاده نمود.

DNA Methylation in exon 1 of CDKN2A gene in formalin-fixed, paraffin-embedded colon cancer samples

Background: The molecular studies indicate some of the genes in the promoter region itself, will undergo methylation. Methylation of CpG islands in the promoter region of that cause silence or reduced expression of genes involved in cell growth pathways, which are colorectal cancer causing agents. Detection of methylation status can be used as a marker for cancer diagnosis and prediction of disease. CDKN2A tumor suppressor gene encodes a protein, which inhibit CDK 4/6 and loss of retinoblastoma protein phosphorylation (pRb) is involved. The purpose of this study was to investigate the molecular hypermethylation in exon 1 of CDKN2A gene in patients with colorectal cancer and normal subjects. Methods: In this casecontrol study, the study population consisted of 20 patients with colorectal cancer and 10 healthy persons. Samples in paraffin blocks were prepared in pathology department of Mehr Hospital, Tehran, Iran, from December 2010 to June 2012. Then, specific primers were designed for the methylation and Nonmethylation of CDKN2A gene. To determine the level of exon 1 methylation of CDKN2A gene, methylationspecific polymerase chain reaction (MSP) method was performed. Results: In this study, hypermethylation in exon 1 of CDKN2A gene were observed in 80% of tumor tissues (16 cases) and 20% of normal tissues (2 cases). The patients aged older than 50 years, had a higher CDKN2A gene methylation and frequency than patients younger than 50 years old (66% vs 34%) (P<0/001). Conclusion: The result of this study has been confirmed the role of CDKN2A gene promoter methylation of CpG sites of colorectal cancer as the leading cause of colorectal cancer. These data suggest that epigenetic silencing via aberrant methylation of the CDKN2A promoter plays a critical role in the inactivation of this tumor suppressor gene in colorectal cancer and can be used as a marker for early detection and identification of potential applications.