مطالعه و بررسی خصوصیات ژنتیکی، فنوتیپی و رفتاری آرکئی‌باکترها و یوباکترها

زمینه و هدف: ژنوم باکتری ها از نظر توالی بازهای نوکلئوتیدی از تنوع قابل توجهی برخوردار است. با پیشرفت علم بیوانفورماتیک امکان مقایسه ژنومی ارگانیسم های زنده افزایش یافته است. پژوهش کنونی با هدف مقایسه خصوصیات ژنومی با خصوصیت دیگر مانند نوع تحرک، نوع تنفس و زیستگاه باکتری در آرکئی باکترها و یوباکترها انجام شد.روش بررسی: در این مطالعه داده های ژنومی 286 گونه آرکئی باکتر و 122 گونه یوباکتر از مرکز ملی داده های زیست فناوری جمع آوری شد. این تعداد شامل تمامی باکتری های ثبت شده در این سایت می باشد که از اردیبهشت تا تیر 1394 در تهران انجام گرفت. میانگین اندازه ژن، تعداد ژن، تعداد پروتیین و درصد c+g در دو گروه یوباکترها و آرکئی باکترها با یکدیگر مقایسه شدند. ارتباط خصوصیات ژنومی با چندین خصوصیت دیگر مانند نوع تحرک، نوع تنفس و زیستگاه باکتری مورد تحلیل و بررسی قرار گرفت.یافته ها: ارتباط اندازه ژن، تعداد ژن، تعداد پروتیین و درصد c+g با خصوصیاتی مانند تحرک، تنفس و زیستگاه باکتری مورد بررسی قرار گرفت. بین اختلاف میانگین ها در دو گروه ارتباط معناداری وجود داشت (0/001=p). اندازه ژنوم در یوباکترها و آرکئی باکترها ارتباط معناداری با خصوصیاتی مانند درصد c+g، تعداد پروتیین، تعداد ژن ها و زیستگاه باکتری داشت (0/001=p). بین اندازه ژنوم و متغیرهایی مانند تعداد سودوژن ها، تحرک و تنفس در یوباکترها ارتباط معنادار بود (0/001=p) اما در آرکئی باکترها این ارتباط معنادار نبود (p>0/05).نتیجه گیری: ژنوم باکتری ها در طی تکامل دچار تغییرات شده که این امر می تواند به کوچک شدن ژنوم و یا کسب برخی از ژن ها منجر گردد. این فرایند می تواند به کاهش تعداد پروتیین، کاهش درصد c+g و محدود ماندن زیستگاه باکتری منجر گردد.