توسعه یک روش multiplex taqman real-time pcr مبتنی بر ژن e6 جهت شناسایی ژنوتیپ های 31 و 33 ویروس hpv در زنان مبتلا سرطان دهانه رحم

زمینه. عفونت با ویروس پاپیلومای انسانی (hpv) مهم ترین عامل خطر در ابتلا به سرطان دهانه رحم محسوب می شود. از آن جا که شناسایی گونه های مختلف این ویروس از طریق روش های سرولوژیک امکان پذیر نیست، بهره گیری از روش های مولکولی مبتنی بر pcr برای تشخیص دقیق و زود هنگام آن اهمیت ویژه ای دارد. هدف از مطالعه حاضر، توسعه و اعتبارسنجی روشی حساس و اختصاصی مبتنی بر taqman real-time pcr به منظور شناسایی ژنوتیپ های 31 و 33 ویروس hpv با استفاده از توالی ژن e6 است. روش کار. در این مطالعه توصیفی-تحلیلی، 50 نمونه پاپ اسمیر بیماران مبتلا به سرطان دهانه رحم بررسی شدند. پس از استخراج dna ژنومی، شناسایی دو ژنوتیپ پرخطر 31 و 33 با استفاده از روش multiplex taqman real-time pcr و بر پایه توالی ژن e6 انجام گرفت. یافته ها. نتایج نشان داد که 28 درصد از نمونه ها به ژنوتیپ های 31 و 33 مثبت بودند. فراوانی ژنوتیپ 33 برابر با 22 درصد و ژنوتیپ 31 معادل 6 درصد بود. همچنین، عفونت هم زمان با هر دو ژنوتیپ در 2 درصد از نمونه ها مشاهده شد. تحلیل داده ها حساسیت 97 درصد و ویژگی 100درصد روش را نشان داد. نتیجه گیری. روش taqman multiplex real-time pcr روشی کارآمد و مقرون به صرفه برای غربال گری ژنوتیپ های 31 و 33 ویروس hpv است. با توجه به دقت بالای این روش، می توان از آن در تشخیص زود هنگام ژنوتیپ هایhpv بهره برد. پیامدهای عملی. با در نظر گرفتن دقت و سرعت بالای این تکنیک، روش مذکور می تواند ابزار مناسبی برای شناسایی ژنوتیپ های پرخطر hpv انسانی باشد.

development of a multiplex taqman real-time pcr method based on the e6 gene for detection of 31 and 33 hpv genotypes in women with cervical cancer

background. infection with human papillomavirus is the most critical risk factor for cervical cancer. given the lack of detection of this virus type by serological methods, using pcr-based molecular methods is particularly important in the accurate and early detection of this virus. the present study aimed to develop and validate a sensitive and specific method based on taqman real-time pcr for detecting hpv 31 and 33 genotypes using the e6 gene sequence. methods. in this descriptive-analytical study, 50 pap smears of patients with cervical cancer were examined. after genomic dna extraction, two high-risk genotypes, 31 and 33, were detected using the multiplex taqman real-time pcr method based on the e6 gene sequence. results. this study showed that 28% of the samples were positive for 31 and 33 genotypes. the frequency of infection with the 33 genotype was 22%, and the 31 genotype was 6%. also, simultaneous infection with both genotypes was observed in 2% of samples. data analysis showed a sensitivity of 97% and a specificity of 100%. conclusion. the taqman multiplex real-time pcr is an efficient and cost-effective method for screening 31 and 33 hpv genotypes. due to its high accuracy, this method can be used for the early detection of hpv genotypes. practical implications. due to its high speed and accuracy, this technique can be suitable and cost-effective for identifying human hpv genotypes.