ارزیابی بیان ژن txnip در آدنوکارسینوم معده و ارتباط آن با بقا کلی بیماران

زمینه. سرطان معده یکی از تومورهای شایع دستگاه گوارش است که بروز آن هر سال افزایش می یابد. سبب شناسی این بیماری پیچیده بوده و هنوز به صورت مبهم باقی مانده است. اخیرا بیشتر مطالعات پایه ای روی عدم تنظیم بیان ژن ها در این سرطان متمرکز شده اند. شواهد روزافزون نشان می دهند بیان پروتئین تعامل کننده با تیرودوکسین (txnip) در بسیاری از تومورهای بدخیم از تنظیم خارج می گردد اما این موضوع در مورد سرطان معده نامشخص است. هدف از مطالعه حاضر بررسی بیان ژن txnip در بافت و حاشیه تومور معده و تعیین ارزش بالینی آن در پیش آگهی و بقا بیماران مبتلا به سرطان معده است. روش کار. تعداد 50 نمونه بافت تومور به همراه بافت حاشیه تومور از بیماران مبتلا به سرطان معده جمع آوری و بیان ژن txnip به روش ریل تایم pcr بررسی شد. همچنین با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی، بیان ژن txnip در دو گروه از بیماران مبتلا به سرطان معده آنالیز شد. برای بررسی نقش پیش آگهی بیان ژن txnip در بقا کلی بیماران از یک مطالعه داده کاوی استفاده گردید. در ادامه برای بررسی بیان txnip در بین سرطان های مختلف از آنالیز داده های پایگاه اطلس ژنوم سرطان استفاده شد. یافته ها. بیان ژن txnip در نمونه های توموری به میزان 0/33 برابر نمونه های سالم کاهش نشان داد. همین یافته در بررسی های بیوانفورماتیکی تکرار شد. کاهش بیان ژن txnip با متاستاز، تمایز پایین تومور و مصرف مواد مخدر ارتباط معناداری داشت. همچنین نتایج این مطالعه نشان داد که سطح بیان ژن txnip با بقا کلی بیماران مبتلا به سرطان معده همبستگی مثبت دارد. آنالیز اطلاعات اطلس ژنوم سرطان نشان داد بیان ژن txnip در چندین مورد از بدخیمی ها کاهش می یابد. نتیجه گیری. مطالعه ما بیان کاهش یافته ژن txnip را به عنوان یک نشانگر پیش آگهی دهنده برای سرطان معده مطرح می کند. همچنین نشان می دهد کاهش بیان ژن txnip احتمالا به نفع متاستاز در سرطان معده است. پیامدهای عملی. بررسی میزان بیان جهت اطلاع از پیش آگهی بیماران مبتلا به سرطان معده آگاهی بخش است.

evaluation of the txnip gene expression in gastric adenocarcinoma and its relationship with overall survival of patients

background. gastric cancer (gc) is a common gastrointestinal tumor, and its incidence is increasing. the pathogenesis of gc is very complex and remains unclear. recent basic studies of gc have focused on gene expression dysregulation. accumulating evidence has demonstrated that thioredoxin-interacting protein (txnip) is abnormally expressed in a variety of malignant tumors but it is obscure in gc. this study aimed to compare the expression of the txnip gene in cancerous and adjacent tissue of gastric cancer and evaluate its clinical significance in the prognosis and survival analysis of gastric cancer patients. methods. a total of 50 tumor tissues and marginal non-tumor control tissues were obtained from gc patients. also, txnip gene expression levels were evaluated by real-time pcr. meanwhile, bioinformatic approaches were used to evaluate txnip expression in two different cohorts of gc patients. a data mining study was also performed to determine the prognostic role of txnip expression in the overall survival of gc. furthermore, a pan-cancer analysis of txnip expression was performed using tcga data. results. the txnip gene was down-regulated in tumor samples with a fold change of 0.33, and the same results were repeated in bioinformatics analysis. decreased expression of txnip was significantly associated with metastasis, poor differentiation, and drug abuse. our results provided evidence that txnip gene expression level is positively correlated with the overall survival of gc patients. pan-cancer analysis of tcga data revealed down-regulated txnip in a variety of malignant tumors. conclusion. this study established low txnip expression as a prognostic biomarker in gc. it also revealed that the decrease in txnip expression likely favors metastatic gc. practical implications. evaluation of txnip expression is informative in the prognosis of gc patients.