جهش جدید در ژن nebl در یک خانواده مبتلا به بیماری کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک: پیچیدگی تفسیر نتایج حاصل از توالی یابی اگزوم کامل

زمینه. کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک شایعترین بیماری قلبی عروقی ژنتیکی است که اغلب دارای توارث اتوزومال غالب می باشد. هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی یک خانواده مبتلا به بیماری کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک با سه فرد مبتلا با استفاده از روش توالی یابی اگزوم کامل می باشد. روش کار. توالی یابی اگزوم کامل بر روی دو فرد مبتلا و یک فرد سالم خانواده انجام شد و واریانت کاندید با استفاده از روش توالی یابی سنگر بر روی سایر اعضای خانواده مورد بررسی قرار گرفت. با توجه به جدید بودن، این کاندید در 200 فرد سالم هم مورد مطالعه قرار گرفت. آنالیزهای مختلف بیوانفورماتیکی برای بررسی بیماری زایی واریانت انجام شدند. یافته. واریانت کاندید در دو فرد مبتلای ارسال شده برای توالی یابی اگزوم و همچنین در یک خواهر و یک برادر به ظاهر سالم وجود داشت. این واریانت جدید بوده و در هیچ یک از پایگاه داده ها وجود نداشت. نتایج اکوکاردیوگرافی بر روی اعضای خانواده نشان داد که یک برادر دیگر پروباند مبتلا به بیماری بوده و فاقد واریانت کاندید بود. بررسی واریانت در یک جمعیت 200 نفری سالم، عدم وجود واریانت را نشان داد. آنالیزهای بیوانفورماتیکی بیماری زا بودن واریانت را نشان دادند. نتیجه گیری. با وجود اینکه همه مطالعات اولیه واریانت کاندید، نشان از عامل ایجاد بیماری بودند، اما مطالعات بعدی بر روی افراد بیشتر خانواده، عامل بودن آن به تنهایی در این خانواده را رد کردند و از این نتایج می توان نتیجه گرفت آنالیز نتایج حاصل از توالی یابی اگزوم نیاز به دقت عمل و مطالعه بیشتر در شجره نامه هایی با تعداد افراد مبتلای بیشتر و مطالعات عملکردی برای اثبات بیماری زا بودن واریانت دارند.

New mutation in the NEBL gene in a family with Hypertrophic cardiomyopathy: Complexity of whole exome sequencing results interpretation

Background. Hypertrophic cardiomyopathy is the most common genetic cardiovascular disease and is predominantly inherited in an autosomal dominant pattern. In this study, genetic analysis of a family affected by hypertrophic cardiomyopathy with three patients was done using wholeexome sequencing. Methods. Wholeexome sequencing was performed on two affected individuals and one healthy family member. The candidate variant was evaluated using Sanger sequencing on other family members. Given the novelty of the candidate variant, it was also studied in 200 healthy individuals. Different bioinformatics analyses were performed to evaluate variant pathogenicity. Results. The candidate variant was present in two affected patients as well as in two apparently healthy siblings. This variant was novel and did not exist in any databases. An echocardiographic result on family members showed that another proband’s brother was affected and did not have a candidate variant. Also, this variant was not found in a population of 200 healthy individuals. Bioinformatics analysis revealed the pathogenicity of the variant. Conclusion. Although all the early studies of the candidate variant showed it as a causative variant, further studies on more individuals of the family rejected its causality alone and from these results, concluding that the results of exome sequencing should be analyzed carefully, and necessitating further study in a pedigree with more affected individuals and functional studies to prove the variant as pathogenic.