حذف 25 جفت بازی ژن mybpc3 در بیماران کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک و جمعیت سالم ایرانی

زمینه: کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک یک بیماری قلبی عروقی شایع ژنتیکی است که منجر به مرگ ناگهانی قلبی در جوانان می شود. این بیماری اغلب به صورت اتوزومال غالب به ارث می رسد و ژن mybpc3 با بیماری مرتبط است. از آنجایی که ناقلین حذف 25 نوکلئوتیدی اینترون 32 ژن mybpc3 در معرض خطر بالاتری برای بیماری قلبی هستند، در این مطالعه بر آن شدیم تا میزان شیوع این حذف ژنی را در بیماران مبتلا به کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک و جمعیت سالم بررسی کنیم. روش کار: 350 نمونه خون شامل 42 بیمار کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک از شمال غرب کشور و 308 فرد سالم فاقد علایم قلبی از جمعیت های مختلف ایرانی جمع آوری شد. پس از استخراج dna و با طراحی پرایمرهای مناسب، ناحیه دربرگیرنده حذف با روش pcr و ژل الکتروفورز بررسی و نتایج ژنوتیپینگ ثبت شد. یافته ها: مشاوره ژنتیک نشان داد که 26.2% از بیماران موارد تک گیر و 59.5% موارد خانوادگی هستند و در 42.3 % از بیماران سابقه مرگ ناگهانی قلبی در افراد درجه یک خانواده وجود داشته است . نتایج ژنوتایپینگ مشخص کرد تمام نمونه ها تنها واجد باند تکی 198 جفت باز بوده و هیچ یک از نمونه ها محصول حاصل از حذف یعنی باند 173 جفت بازی را نشان ندادند که نشان دهنده عدم وجود جهش حذفی در بیماران hcm و همچنین گروه 308 نفری افراد کنترل بود. ارزیابی های بیوانفورماتیک مشخص کرد که حذف 25 جفت بازی ژن mybpc3 روی پایگاه داده ژنوم ایرانیان (iranome) فرکانس 0.00438 را دارد که بیشترین تعداد بروز در جمعیت بلوچ گزارش شده است. نتیجه گیری: بررسی جمعیت ها از نظر عوامل مستعد کننده کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک به جهت ارتباط با مرگ ناگهانی اهمیت به سزایی دارد . مطالعه ما نشان داد که این جهش در جمعیت بیماران شمال غرب کشور از عوامل خطر محسوب نشده و با توجه به یافته های بیوانفورماتیک و مطالعات کشورهای همسایه پیشنهاد می شود در جمعیت های شرقی و جنوبی کشور بررسی شود.

MYBPC3Δ25bp intronic deletion in hypertrophic cardiomyopathy patients and healthy Iranian population

Background: Hypertrophic cardiomyopathy is a common genetic cardiovascular disease with autosomal dominant inheritance and MYBPC3 gene has been frequently linked to its pathogenesis. Since, carriers of the 25 nucleotides deletion located on intron 32 of the MYBPC3 are at increased risk of heart disease we aimed to investigate this variant in hypertrophic cardiomyopathy patients and healthy population. Methods: DNA was extracted from 350 Blood samples including 42 hypertrophic cardiomyopathies and 308 healthy subjects and the region containing the deletion was amplified by PCR method. PCR products were analyzed on agarose gel and genotyping results were recorded. Results: Genetic counseling results revealed that 26.2% of patients were sporadic cases vs 59.5% with positive family history and there was a history of sudden cardiac death in the first degree relatives of 42.3% of the patients. Genotyping results showed that all samples had a single band of 198 bp, indicating no MYBPC3Δ25bp variant in HCM patients as well as 308 controls. Bioinformatics assessments revealed that MYBPC3Δ25bp had a frequency of 0.00438 on Iranome database with the highest incidence reported in the Baloch population. Conclusion: Since hypertrophic cardiomyopathy is related to sudden cardiac death, population studies in terms of predisposing factors are of particular importance. Our study results showed that MYBPC3Δ25bpshould not be considered as risk factor in the patients of northwest of Iran. However, according to the bioinformatics findings and reports of neighboring countries, it is suggested that MYBPC3Δ25bp to be studied in the eastern and southern Iranian hypertrophic cardiomyopathy patients.