|
|
ترکیبات اسانس اسطوخودوس به عنوان آنتاگونیست های زیرواحد nr2b مربوط به گیرنده nmda : یک روش آزمایشگاهی و مد لسازی مولکولی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
رمضانی صدراله ,دهقان شاسلطنه مرضیه ,امیری خوری محمدمهدی
|
منبع
|
مجله علمي پزشكي جندي شاپور - 1401 - دوره : 21 - شماره : 2 - صفحه:246 -262
|
چکیده
|
زمینه و هدف گیاهان دارویی٬ منبع مهم مواد طبیعی با اثرهای درمانی مختلف هستند. هدف از مطالعه حاضر، تعیین ترکیبات شیمیایی اسانس گیاه اسطوخودوس و ارزیابی اثر آنتاگونیست آ نها بر روی گیرنده های انِ متیل دی آسپارتیک اسید در مغز با استفاده از دستگاه کروماتوگرافی گاز ی طی فسنجی جرمی و رویکردهای محاسباتی است.روش بررسی اسانس سرشاخه های گلدار )گل و برگ( استخراج و ترکیبات شیمیایی آن توسط کروماتوگرافی گازی-طی فسنجی جرمی تعیین شد. داکینگ مولکولی و ارزیابی ساختارهای مولکولی روی 20 ترکیب مهم گیاه صورت گرفت. از اتوداک وینا مربوط به نرم افزارپایرکس برای انجام داکینگ مولکولی 20 لیگاند با nmdar استفاده شد. ابزار وب swissadme برای بررسی مقادیر توصیف کننده مولکولی به کار گرفته شد.یافته ها تعداد 41 ترکیب در اسانس گیاه اسطوخودوس شناسایی شد که 5/ 95 درصدکل اسانس را تشکیل می دهند. بیشترین مقدارترکیبات به ترتیب مربوط به ترانس کاروئول، ایزوپولگول، 8،3،1 - پارا-منتاترین و ایزوبورنئول بود. مطالعات داکینگ نشان داد 3 مورد ازبهترین لیگاندها برای اتصال به گیرنده انِ متیل دی آسپارتیک اسید شامل ترانس کاروئول، ایزوپولگول و 8،3،1 - پارا-منتا ترین است که میل ترکیبی بیشتری نسبت به جایگاه فعال nmdar نشان دادند. آیفن پرودیل به عنوان یک آنتاگونیست، مکا نهای اتصال مشترک را باکامفور، تیمول، آلفا فلاندرن، لیمونن، گاما - 3- کارن، بتا-توجون، ترانس کاروئول و بتا-کاریوفیلن نشان دادند. کامفور، تیمول، بتا- توجونو ترانس کاروئول بیشترین جذب گوارشی و ترانس کاروئول کمترین انرژی اتصال با nmdar را داشتند.نتیجه گیری کامفور، تیمول، بتا-توجون و تران سکاروئول م یتوانند به عنوان یک هدف اصلی بالقوه برای مهار nmdar بهبود یادگیری وحافظه در بیماریهای عصبی انتخاب شوند.
|
کلیدواژه
|
بیماری آلزایمر، اسطوخودوس، داکینگ مولکولی، آنتاگونیست گیرنده انِ متیل دی آسپارتیک اسید
|
آدرس
|
دانشگاه سیستان و بلوچستان, دانشکده جغرافیا و برنامه ریزی محیطی, گروه گیاهان دارویی, ایران, دانشگاه زنجان, دانشکده علوم پایه, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, دانشکده کشاورزی, گروه علوم باغبانی, باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان, ایران
|
پست الکترونیکی
|
dehghanmarzieh@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
lavender essential oil compounds as antagonists of nmda receptor subunitnr2b: a molecular modeling and experimental study
|
|
|
Authors
|
ramezani sadrollah ,ddehghan shasaltaneh marzieh ,amiri khorie muhammad mehdi
|
Abstract
|
background and objectives herbal plants are an important source of novel chemical drugs with therapeuticeffects. the present study aims to find the chemical compounds of the essential oil of lavender(lavandula angustifolia miller) and assess their antagonistic effects on n-methyl-d-aspartate receptor(nmdar) subunit nr2b in the brain.subjects and methods the essential oil was first isolated by distillation method from flowering inflorescencesof lavender. then, their chemical compounds were identifies by gas chromatography/massspectrometry (gc-ms). molecular docking study and the evaluation of the molecular structures werecarried out on 20 compounds. pyrx software, version 4.0 in autodock vina was used to perform themolecular docking of 20 ligands with nmdar. the molecular structures of compounds were evaluatedin swissadme website.results in gc-ms, 41 active compounds were detected comprising 95.5% of the total essential oil oflavender plant. the highest amount was related to trans-carveol, followed by isopulegol, 1,3,8, -p-menthatriene,and isoborneol. in docking studies, results showed that the best ligands for binding to nmdarincluded trans-carveol, isopulegol, and 1,3,8, -p-menthatriene which demonstrated the higher affinity toactive site of the nmdar. ifenprodil, as an antagonist, shared common binding sites with camphor, thymol,alpha-phellandrene, limonene, gamma-3-carene, beta-thujone, trans-carveol, beta-caryophyllene.camphor, thymol, beta-thujone and trans-carveol had the highest gastrointestinal absorption, and transcarveolhad the lowest binding energy to nmdar.conclusion camphor, thymol, beta-thujone, and trans-carveol are potential compounds of lavender essentialoil to inhibit nmdar and improve learning and memory in neurodegenerative diseases.
|
Keywords
|
alzheimer’s disease ,lavender ,molecular docking ,nmda receptor ,antagonist
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|