مروری بر بررسی های بیوانفورماتیکی عملکرد پروتئین های ساختاری، غیرساختاری و سطح گلیکوپروتئین مهارکننده متابولیسیم پروتئین هِم توسط کرونا ویروس

زمینه و هدف ذات الریه کووید- 19 یک عفونت حاد تنفسی ناشی از ویروس کرونای جدید است. این ویروس، یک rna ویروس باهمولوژی بالا با کرونا-ویروس خفاش است.روش بررسی در این مطالعه مروری، ابتدا ویژگی های سلولی مولکولی، تکثیر و همانندسازی ویروس کرونای جدید بررسی شده و سپس به کمک مطالعات بیوانفورماتیکی انجام شده درخصوص تحلیل دامین حفاظ ت شده ویروس، مد لسازی همولوژی، داکینگ مولکولیو نقش های زیستی برخی از پروتئین های خاص ویروس کرونای جدید بررسی شد. orf8 و گلیکوپروتئین سطحی به ترتیب می توانند به پورفرین متصل شوند. orf1ab ،orf10 و orf3a می توانند با پروتئین هِم روی زنجیره 1 - بتا در هموگلوبین هماهنگ شوند تاآهن را تجزیه و پورفرین را شکل دهند. این حمله باعث کاهش هموگلوبینی که اکسیژن و د یاکسید کربن را حمل می کند،می شود ودرنتیجه سلو ل های ریه به علت ناتوانی در مبادله کربن دی اکسید و اکسیژن ملتهب میشود. التهاب سلولهای ریه منجر به تصاویر بزرگ توده مانند در در تصویربرداری سی-تی اسکن می شوند.یافته ها باتوجه به تحلیل نتایج بیوانفورماتیکی، کلروکین می تواند از عملکرد orf1ab، orf10 و orf3a برای حمله به هموگلوبین)برای تشکیل پورفرین( جلوگیری کند. درنتیجه، تا حد معینی مانع از اتصال orf8 و گلیکوپروتئین های سطحی به پورفرین می شود.بدین ترتیب، کلروکین می تواند به طور موثر علائم حاد تنفسی را تسکین دهد.نتیجه گیری باتوجه به همه گیری کنونی،پژوهندگان براین باور هستند که نتایج تحقیقات بیوانفورماتیکی در پیشگیری از شیوع ذات الریه ویروس کرونا، توسعه داروها و واکسن ها و درمان بالینی، ارزش بالایی دارند.

a review of bioinformatics studies on the function of structural and nonstructuralproteins and the level of glycoprotein inhibiting heme metabolismby sars-cov-2 virus

coronavirus disease 2019 (covid-19) is an acute respiratory infection. its virus called sars-cov-2 whichis an rna virus with high homology to the bat coronavirus. in this review study, first the molecular andcellular characteristics and the proliferation and replication of sars-cov-2 are investigated. then, by reviewingbioinformatics studies regarding protected domain analysis, homology modeling, and moleculardocking, the biological role of some specific sars-cov-2 proteins are examined. the results showed thatthe open reading frame 8 (orf8) and surface glycoprotein could bind to porphyrin. at the same time,orf1ab, orf10, and orf3a can attack the heme part of hemoglobin to dissociate iron and form porphyrin.this attack reduces hemoglobin ability to carry oxygen and carbon dioxide. as a result, lung cellsbecome severely inflamed due to their inability to exchange carbon dioxide and oxygen, which leads tolarge ground-glass opacities on ct scan images. based on the bioinformatics results, chloroquine canprevent orf1ab, orf3a, and orf10 from attacking hemoglobin to form porphyrin and avoid the bindingof orf8 and surface glycoprotein to porphyrin, which effectively relieves the symptoms of acute respiratorysyndrome. in the current pandemic, bioinformatics studies are of great importance for preventingthe spread of covid-19, developing drugs and vaccines, and clinical practice.