بررسی بیان ژن های hotair و hoxc13 در بافت های توموری و نرمال حاشیه تومور در بیماران مبتلابه سرطان مری

زمینه و هدف اسیدهای ریبونوکلئیک غیر کدکننده طولانی یکی از مولکول هایی هستند که با پیشرفت سرطان همراهی دارند. hotairعضوی از خانواده اسیدهای ریبونوکلئیک غیر کدکننده طولانی است. ژن hoxc13 یکی از چندین ژن هاکس است که در نزدیکی ژنhotair قرار گرفته است. مطالعه حاضر با هدف بررسی بیان ژن hotair و hoxc13 در بافت های توموری سرطان مری و نرمال حاشیه تومور انجام شد.روش بررسی این مطالعه تجربی است. 30 جفت بافت تومور مری و بافت حاشیه تومور آن خریداری شد، اسید ریبونوکلئیک این بافت ها استخراج می شود و برای بررسی بیان نسبی آن ها از روش ریل تایم پی سی آر به همراه ژن بتا اکتین استفاده شد. برای آنالیز آماری داده ها از آزمون آماری تی تست و تحلیل واریانس و با نسخه 8 نرم افزار گراف پد پریسم انجام شد. یافته ها مقایسه میزان بیان ژن هدف در نمونه های توموری مری نسبت به حاشیه تومور نشان داد بیان نسبی ژن 1/95 hotair برابر (p= 0/0219 ) و 14/4 hoxc13 برابر ( 014 / p= 0 ) بهطور معنادار افزایش بیان وجود دارد. همچنین بیان ژن hoxc13 با متاستاز به نواحی دور، نوع و درجه تومور رابطه معناداری را نشان می دهد. ضریب همبستگی میان بیان نسبی ژن های hotair و hoxc13 ، 0/152به دست آمد که میان این دو ژن همراهی مثبت بود، اما معنادار نبود (0/2= p) نتیجه گیری با توجه به ارتباط دو ژن hoxc13 و hotair با سرطان، این مطالعه تا حدی می تواند بیان کننده نقش این دو ژن در فرآیند تومورزایی در گسترش سرطان مری باشد.

Evaluation of HOTAIR and HOXC13 Genes in Tumor And Normal Tissues Adjacent to Tumor in Patients with Esophageal Cancer

Background and Objectives One of the molecules that associated with cancer progression are Long noncoding RNA (LncRNAs). HOX transcript antisense RNA (HOTAIR) is a member of the lncRNA family. HomeoboxC13 (HOXC13) gene is one of the several HOX genes that is located near the HOTAIR. This studywas to evaluate the expression of HOTAIR and HOXC13 genes in tumor and normal tissues adjacent totumor in patients with esophageal cancer.Methods This is an experimental study. 30 pairs of esophageal tumor tissue and tumor margin tissuewere purchased. RNA of these tissues was extracted and Real-time PCR with Beta-actin gene was usedfor their relative expression. Statistical analysis of data, t-test and Analysis of variance (ANOVA) wereperformed in GraphPad Prism 8 software.Results Comparison of target gene expression in esophageal tumor samples relative to tumor marginsshowed that the relative expression of the HOTAIR genes was 1.95 time (P=0.0219) and the HOXC13 14.4time (P=0.014) significantly increased expression. Also, the HOXC13 gene expression shows a significantrelationship with metastasis to distant regions, type and degree of tumor. The correlation coefficientbetween the relative expression of the HOTAIR and the HOXC13 genes was 0.152. It was positive but notsignificant between the two genes (P=0.2).Conclusion According to the association of the HOTAIR and the HOXC13 genes with cancer, our studymay partially express the role of these two genes in the tumorigenesis process in the development ofesophageal cancer.