تعیین گروه‌های فیلوژنتیک و مقاومت آنتی‌بیوتیکی در ایزوله‌های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک و کامنسال جدا شده از شهر زنجان

زمینه و هدف: سویه های اشریشیاکلی عامل اصلی عفونت مجاری ادراری (uti) بوده که به گروه بزرگی از اشریشیاکلی های بیماریزای خارج رودهای تعلق دارند. این باکتریها به چهار گروه اصلی فیلوژنتیک b2, b1 ,a و d تقسیم میشوند. هدف از مطالعه ی حاضرتعیین گروه های فیلوژنتیک در اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک و کامنسال بود و با توجه به افزایش مصرف آنتی بیوتیک ها و افزایش مقاومت دارویی، ارزیابی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی سویه های اشریشیاکلی و اروپاتوژن جداسازی شده از بیماران مشکوک به عفونت ادراری نیز انجام گرفت. روش بررسی: در این مطالعه ی مقطعی توصیفی 137 ایزوله ی اشریشیاکلی اوروپاتوژن از بیماران مشکوک به عفونت ادراری از بیمارستان های زنجان و 50 ایزوله از نمونه های مدفوع بالغین سالم جمع آوری شد. بعد از تایید ایزوله ها با روش های بیوشیمیایی و استخراج dna کل، pcr توسط پرایمرهای اختصاصی برای گروه بندی فیلوژنتیک انجام گرفت. حساسیت آنتیمیکروبی ایزوله های تایید شده اشریشیاکلی اوروپاتوژن (باروش دیسک دیفیوژن)، طبق دستورالعمل clsiدربرابر با سیزده آنتی بیوتیک انجام گرفت. یافته ها: براساس نتایج به دست آمده از تست مقاومت آنتی بیوتیکی بیشترین میزان مقاومت به ترتیب مربوط به آمپی سیلین (5/74 درصد) و آزترئونام (1/59 درصد) بود، همچنین کمترین میزان مقاومت دربرابر ایمیپنم (5/1 درصد) و آمیکاسین (9/10 درصد) گزارش شد. ارزیابی pcr گروه های فیلوژنتیک سویه های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک نشان داد که بیشترین میزان فراوانی مربوط به گروه b2 (15/67درصد) سپسd (17/21 درصد) و a (68/11 درصد) بود و گروه فیلوژنتیک b1 در ایزوله های اوروپاتوژنیک مشاهده نشد. در ایزوله های اشریشیاکلی کامنسال فراوانی گروه ها به ترتیب مربوط به d 52 درصد، b2 24 درصد، a 14 درصد و b1 10درصد بود. نتیجه گیری: نتایج حاصله نشان داد که درصد فراوانی گروه های فیلوژنتیکی b2 و d در ایزوله های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک و کامنسال مورد مطالعه بالا بوده است.

Determination of Phylogenetic Groups and Antibiotic Resistance in Uropathogenic and Commensal Escherichia Coli Isolated from Patients in Zanjan City

Background and Objective: Escherichia coli strains are the major cause of urinary tract infections which belong to the large group of extraintestinal pathogenic E. coli. They fall into four main phylogenetic groups: A, B1, B2 and D. The aim of the present study was to determine phylogenetic groups in uropathogenic and commensal Escherichia coli isolated. Also, due to increase in the rate of antibiotic usage and subsequent drug resistance, this study evaluated the antimicrobial resistance pattern of E. coli isolated from patients with UTI.Materials and Methods: In this crosssectional study, 137 uropathogenic Escherichia coli isolates were collected from the clinical specimens of Zanjan hospitals and 50 isolates were collected from healthy adults. After verifying isolates via biochemical methods and extraction of total DNA, Multiplex PCR was done by specific primers for phylogenetic grouping. The antibiotic susceptibility test (disk diffusion method) was done according to CLSI advice against 13 antibiotics.Results: In this study, the highest rates of resistance to antibiotics in UTI isolates were seen against ampicillin (74.5%) and aztreonam (59.1%). Also, the lowest rates of resistance were reported against imipenem (1.5%) and amikacin (10.9%).The distribution of UPEC phy logenetic groups typing marked the highest prevalence in group B2 (67.15 %) , and then in group D (21.17%) and the lowest prevalence in group A (11.68%). Phy logenetic B1 was not observed in uropathogenic isolates. Among the commensal isolates, 52% belonged to phylogenetic group D, 24% to B2, 14% to A, and10% to B1.Conclusion: The results indicate the higher prevalence of B2 and D phylogenetic groups in commensal and uropathogenic Escherichia coli strains in Zanjan.