بررسی وضعیت متیلاسیون در پروموتور ژن‌های vHL، Runx3 و Ecad و بیان این ژن‌ها در سلول‌های CD34+ خون بند ناف

زمینه و هدف: فرایندهای تمایزی ویژه به رده‌های گوناگون سلولی، با فاکتورهایی نظیر فاکتورهای نسخه برداری، عناصر سرکوبگر تومور و عناصر سیگنالینگ داخل سلول دارای ارتباط تنگاتنگ است که گروهی از این فاکتورها شامل vhl، ecad و runx3می‌باشند. مکانیسم‌های کنترلی تاثیرگذار توسط این فاکتورها نیز اپی ژنتیک است که دارای مکانیسم‌های متعددی از جمله متیلاسیون و استیلاسیون می‌باشد. در واقع هدف اصلی مطالعه‌ی ذیل، بررسی وضعیت بیان ژن‌های vhl، ecad و runx3 در سلول‌های بنیادی cd34+ خون بند ناف و آشکار ساختن الگوی متیلاسیون ژن‌های موردنظر در این مرحله ‌بود.روش بررسی: پس از جداسازی سلول‌های بنیادی از خون بند ناف و کشت سلول‌های موردنظر در محیط مخصوص و نیز تخلیص ژنوم از سلول‌ها، در مرحله‌ی اول از rna مورد نظر، cdna ساخته شد و واکنش pcr نیز برای ژن‌های مورد مطالعه انجام گرفت. در مراحل بعدی نیز از dna پردازش شده مراحل قبل، برای انجام واکنش‌های msp استفاده شد.یافته‌ها: پس از انجام واکنش pcr با پرایمرهای طراحی شده برای استفاده در real time pcr و cdna مربوط به rna سلول‌های بنیادی، این نتایج به‌دست آمد که همه‌ی ژن‌های مورد مطالعه، در سلول‌های بنیادی cd34+ بیان می‌شوند. با انجام mspدر مرحله‌ی دیگری از مطالعه نیز مشخص شد که ژن‌های ecad و runx3 دارای متیلاسیون و بیان نسبی و ژن vhl نیز فاقد متیلاسیون و بیان کامل تحت این شرایط بودند.نتیجه‌گیری: همخوانی قابل توجهی بین بیان یک ژن و تغییرات اپی ژنتیک وجود دارد و بیان هر سه ژن مورد مطالعه، نشان دهنده‌ی نقش موثر آ‌ن‌ها در بیولوژی و عملکرد سلول‌های بنیادی خونساز دارد.واژگان کلیدی: متیلاسیون- سلول‌های بنیادی خونساز- خون بند ناف- vhl - runx3 – ecad