ارزیابی جامع بیوانفورماتیکی بیان ترشحی هورمون رشد انسانی با توالی‌های راهنمای مناسب در escherichia coli: مطالعه in silico

مقدمه: امروزه، مهندسی ژنتیک و بیوانفورماتیک، تولید انبوه پروتئین‌های نوترکیب دارویی در باکتری escherichia coli را که دارای ویژگی‌های منحصر به فرد بیانی است، به امری معمول و اقتصادی تبدیل کرده است. در این ارزیابی بیوانفورماتیکی، تولید پری‌پلاسمیک هورمون رشد انسانی بررسی گردید. هدف از انجام این تحقیق، ارزیابی جامع بیوانفورماتیکی 48 توالی راهنمای انسانی توسط پایگاه‌های داده‌ی معتبر به منظور بررسی بیان پروتئین نوترکیب هورمون رشد انسانی در میزبان escherichia coli بود.روش‌ها: با استفاده از پایگاه داده‌ی قدرتمند signalp نسخه‌ی 4.1، صحت و دقت جایگاه برش تعداد 48 توالی‌ راهنما ارزیابی و گزینش شدند. خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی راهنمای باقی‌مانده، توسط پایگاه‌های داده‌ی‌ genescript و protparam مورد بررسی قرار گرفتند. قابلیت حل شدن پروتئین، فعالیت ترشحی پس از بیان و ساز و کار انتقال توالی‌های راهنما توسط پایگاه‌های داده‌ی solpro، protcompb و predtat، بررسی شدند.یافته‌ها: بر اساس نتایج به دست آمده به صورت تئوری، توالی‌های راهنمای مناسب برای اتصال به پروتئین هورمون رشد انسانی به ترتیب فسفوپروتئین بزاقی غنی شده با پرولین (proline rich protein haeiii subfamily 1 یا prh1)، پروتئین ترشح شده‌ی c10orf99 و پپتید رها کننده‌ی پرولاکتین (prolactinreleasing hormone یا prlh) پیش‌بینی شد.نتیجه‌گیری: بیان ترشحی، مزایایی را در مقابل بیان سیتوپلاسمیک ایجاد می‌کند. نتایج این تحقیق، نشان داد که با بررسی توالی‌های راهنمای مختلف در اتصال با پروتئین هورمون رشد انسانی، دستیابی به توالی‌های دارای پتانسیل و قابلیت بیان ترشحی بهتر امکان پذیر شده است. لازم است در مطالعات آتی صحت این نتایج بررسی گردد.